More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3068 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3068  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
394 aa  794    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.42 
 
 
677 aa  82.8  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  27.3 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  23.8 
 
 
490 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.2 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.92 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.35 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.85 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  27.63 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  26.01 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  26.45 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.17 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  23.14 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  27.17 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  26.15 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.32 
 
 
486 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.04 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  26.22 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.38 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  24.06 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  28.04 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  28.09 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.51 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.31 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  26.47 
 
 
486 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.19 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  23.99 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.69 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.73 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.31 
 
 
498 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  23.99 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.85 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.76 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  25.34 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  28.51 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  27.08 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  23.85 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.54 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  25.07 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  29.56 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.63 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  26.44 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.85 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  26.55 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  29.6 
 
 
502 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.7 
 
 
459 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.85 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.74 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  24.36 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.1 
 
 
487 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  22.66 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  28.09 
 
 
479 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  25.63 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  26.79 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  25.38 
 
 
472 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  25.52 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.07 
 
 
481 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  29.01 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.11 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.43 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  28.37 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  24.26 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.36 
 
 
478 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  26.14 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.99 
 
 
472 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  25.72 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  27.35 
 
 
502 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  24.52 
 
 
476 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.11 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  23.62 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 
478 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  27.49 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.11 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.11 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  24.11 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  26.18 
 
 
490 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  26.79 
 
 
477 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
489 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  27.14 
 
 
480 aa  63.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  29.48 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  26.79 
 
 
477 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.44 
 
 
476 aa  63.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1047  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.69 
 
 
900 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170662  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  23.9 
 
 
458 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.85 
 
 
485 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.06 
 
 
486 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.41 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.07 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  23.3 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  25.15 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  22.82 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  22.82 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  22.82 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 
537 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  29 
 
 
474 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  26.46 
 
 
486 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  21.04 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  22.82 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  22.82 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>