100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1408 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  100 
 
 		 299 aa  621  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  100 
 
 		 299 aa  621  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  90.27 
 
 		 299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  60.67 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.57 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  23.08 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  25.22 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.22 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.36 
 
 		 536 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  23.24 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  23.21 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  23.75 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  23.91 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0305  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.88 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.71 
 
 		 611 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.02 
 
 		 622 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  24.56 
 
 		 550 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.54 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  22.94 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  23.84 
 
 		 559 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  30.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  30.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  30.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  31.15 
 
 		 223 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  30.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  30.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  30.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  28.47 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.32 
 
 		 484 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.82 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.22 
 
 		 472 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.62 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  29.63 
 
 		 481 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.47 
 
 		 486 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  24.05 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  27.14 
 
 		 397 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  24.17 
 
 		 477 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.64 
 
 		 586 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  27.86 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  31.17 
 
 		 486 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  27.33 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  24.7 
 
 		 482 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  24.54 
 
 		 500 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  24.03 
 
 		 505 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  28.69 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.08 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.4 
 
 		 479 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  23.51 
 
 		 472 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  24.03 
 
 		 505 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  26.09 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.55 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  26.11 
 
 		 397 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  23.98 
 
 		 558 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.75 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.55 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  21.82 
 
 		 484 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.11 
 
 		 397 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.55 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.43 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.39 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.43 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.55 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.75 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  29.75 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  25.87 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  27.21 
 
 		 386 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.84 
 
 		 472 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.08 
 
 		 560 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  27.33 
 
 		 479 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  30.4 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  28.68 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  27.27 
 
 		 183 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.49 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  24.45 
 
 		 700 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.67 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  32.67 
 
 		 186 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  28.79 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  28 
 
 		 480 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  26.47 
 
 		 758 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  26.24 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  24.36 
 
 		 479 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  25.53 
 
 		 479 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  53.85 
 
 		 189 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  26.06 
 
 		 485 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.75 
 
 		 551 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  26.74 
 
 		 479 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  26.67 
 
 		 478 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  26.74 
 
 		 481 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  27.87 
 
 		 490 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.45 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 478 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.5 
 
 		 498 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  23.94 
 
 		 397 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  22.16 
 
 		 476 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  41.3 
 
 		 417 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5469  cardiolipin synthetase domain protein  25.69 
 
 		 397 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  25.83 
 
 		 448 aa  42.4  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.67 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>