299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11913 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  63.36 
 
 
701 aa  901    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  60.43 
 
 
692 aa  859    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  100 
 
 
700 aa  1428    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  44.13 
 
 
696 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  43.79 
 
 
718 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  43.45 
 
 
701 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  43.41 
 
 
709 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  41.68 
 
 
730 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  43.62 
 
 
690 aa  561  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  42.05 
 
 
720 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  42.05 
 
 
720 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  41.85 
 
 
684 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  41.86 
 
 
723 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  41.86 
 
 
723 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  43.47 
 
 
690 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  41.86 
 
 
723 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  41.9 
 
 
720 aa  558  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  43.67 
 
 
722 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  41.86 
 
 
723 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  42.73 
 
 
686 aa  555  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  43.56 
 
 
687 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  43.39 
 
 
689 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
688 aa  555  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  42.47 
 
 
689 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  42.75 
 
 
694 aa  551  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  43.13 
 
 
687 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  43.13 
 
 
687 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  41.45 
 
 
720 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  43.13 
 
 
687 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  41.15 
 
 
724 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  42.75 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  42.75 
 
 
688 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  42.75 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  42.75 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  42.75 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
690 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  39.42 
 
 
695 aa  483  1e-135  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  38.83 
 
 
690 aa  468  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  36.82 
 
 
679 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  35.98 
 
 
715 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  34.73 
 
 
708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  33.62 
 
 
691 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  36.27 
 
 
736 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  36.95 
 
 
712 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01710  polyphosphate kinase  35.57 
 
 
1099 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.249117  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  33.14 
 
 
687 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  35.01 
 
 
746 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  33.91 
 
 
720 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  34.86 
 
 
746 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  33.84 
 
 
731 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  34.99 
 
 
687 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  33.24 
 
 
728 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  34.86 
 
 
696 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  33.77 
 
 
681 aa  392  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  32.4 
 
 
769 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  33.71 
 
 
737 aa  389  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  33.28 
 
 
702 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  33.28 
 
 
705 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  32.42 
 
 
695 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  34.54 
 
 
720 aa  389  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  34.13 
 
 
715 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  33.64 
 
 
764 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  33.95 
 
 
749 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  34.71 
 
 
721 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  33.19 
 
 
801 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  33.29 
 
 
750 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  31.33 
 
 
760 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  33.43 
 
 
702 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  34.63 
 
 
713 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  32.76 
 
 
710 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  32.26 
 
 
702 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  34.35 
 
 
736 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  33.99 
 
 
694 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  34.88 
 
 
700 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  34.24 
 
 
775 aa  382  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  32.52 
 
 
727 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  33.06 
 
 
708 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  32.86 
 
 
759 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0494  polyphosphate kinase  33.92 
 
 
728 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  32.96 
 
 
754 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  32.68 
 
 
726 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  33.67 
 
 
695 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  33.83 
 
 
736 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  33.95 
 
 
749 aa  379  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  33.48 
 
 
712 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  33.88 
 
 
882 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  33.63 
 
 
702 aa  379  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  32.64 
 
 
724 aa  379  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  33.68 
 
 
736 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  33.04 
 
 
731 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  34.5 
 
 
721 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  34.66 
 
 
709 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>