More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01710 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04170  polyphosphate kinase  56.53 
 
 
951 aa  813    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01710  polyphosphate kinase  100 
 
 
1099 aa  2205    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.249117  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0719  Polyphosphate kinase  60.58 
 
 
862 aa  848    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0494  polyphosphate kinase  42.36 
 
 
728 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  39.52 
 
 
702 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  39.27 
 
 
721 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  39.38 
 
 
702 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  39.52 
 
 
702 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  39.52 
 
 
700 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  39.38 
 
 
702 aa  466  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  39.38 
 
 
702 aa  466  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  39.38 
 
 
702 aa  466  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  39.38 
 
 
702 aa  466  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  39.52 
 
 
702 aa  466  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  39.38 
 
 
702 aa  466  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  38.95 
 
 
720 aa  453  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  38.1 
 
 
708 aa  452  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  38.46 
 
 
710 aa  449  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  37.24 
 
 
681 aa  442  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  36.23 
 
 
743 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1603  Polyphosphate kinase  38.2 
 
 
705 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  37.09 
 
 
701 aa  425  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  38.19 
 
 
712 aa  426  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  37.72 
 
 
754 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  37.16 
 
 
708 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  36.51 
 
 
801 aa  422  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  36.35 
 
 
745 aa  422  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  38.75 
 
 
750 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  37.29 
 
 
731 aa  422  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  36.52 
 
 
715 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  38.92 
 
 
749 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  36.83 
 
 
788 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  37.61 
 
 
736 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  35.89 
 
 
722 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  35.89 
 
 
722 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  36.33 
 
 
695 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  36.83 
 
 
788 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  37.59 
 
 
788 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  35.98 
 
 
721 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  36.44 
 
 
733 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  36.79 
 
 
731 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  36.84 
 
 
790 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1334  polyphosphate kinase  36.08 
 
 
697 aa  413  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  36.19 
 
 
735 aa  412  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  36.18 
 
 
726 aa  412  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  35.75 
 
 
728 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0938  polyphosphate kinase  38.39 
 
 
695 aa  411  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  35.03 
 
 
720 aa  413  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  36.44 
 
 
741 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  35.23 
 
 
702 aa  412  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0875  polyphosphate kinase  36.52 
 
 
696 aa  412  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.458341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  35.6 
 
 
728 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  34.65 
 
 
746 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  36.78 
 
 
823 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  36.48 
 
 
736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  36.53 
 
 
728 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  34.65 
 
 
746 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  35.56 
 
 
731 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  35.42 
 
 
740 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0727  polyphosphate kinase  35.67 
 
 
697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  36.12 
 
 
759 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0337  polyphosphate kinase  36.15 
 
 
747 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  36.2 
 
 
736 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  34.51 
 
 
764 aa  405  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  34.69 
 
 
734 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  36.16 
 
 
700 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  36.15 
 
 
733 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  35.69 
 
 
724 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  35.59 
 
 
714 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  34.79 
 
 
736 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  36.08 
 
 
702 aa  403  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  34.2 
 
 
720 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  35.87 
 
 
736 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  35.34 
 
 
721 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  34.54 
 
 
734 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  36.64 
 
 
882 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  35.14 
 
 
775 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  35.26 
 
 
684 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0339  polyphosphate kinase  34.9 
 
 
694 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.984147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  35.21 
 
 
696 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  35.17 
 
 
813 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1724  polyphosphate kinase  35.94 
 
 
696 aa  398  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  34.16 
 
 
710 aa  399  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  36.23 
 
 
727 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  35.45 
 
 
729 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1548  polyphosphate kinase  34.63 
 
 
694 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3654  polyphosphate kinase  35.31 
 
 
702 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0555564  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  35.16 
 
 
745 aa  395  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  35.12 
 
 
722 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  35.3 
 
 
765 aa  395  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  33.62 
 
 
753 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1361  polyphosphate kinase  34.76 
 
 
694 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  35.82 
 
 
728 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  35.24 
 
 
721 aa  393  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  35.29 
 
 
700 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  35.99 
 
 
714 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  36.48 
 
 
727 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1578  polyphosphate kinase  35.52 
 
 
700 aa  392  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  35.37 
 
 
724 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1022  polyphosphate kinase  34.47 
 
 
697 aa  390  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.665381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>