298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2402 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0938  polyphosphate kinase  49.28 
 
 
695 aa  665    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  100 
 
 
720 aa  1486    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  46.48 
 
 
715 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  46.86 
 
 
743 aa  598  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  43.39 
 
 
702 aa  591  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  43.19 
 
 
702 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  43.19 
 
 
702 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  43.19 
 
 
702 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  43.02 
 
 
702 aa  588  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  43.33 
 
 
702 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  43.19 
 
 
702 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  43.04 
 
 
700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  42.75 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  44.64 
 
 
710 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  43.35 
 
 
681 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  42.39 
 
 
702 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  46.02 
 
 
722 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  46.02 
 
 
722 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  44.1 
 
 
708 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  43.88 
 
 
712 aa  568  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  46.29 
 
 
714 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  44.87 
 
 
695 aa  565  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  44.84 
 
 
720 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  44.85 
 
 
715 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.04 
 
 
708 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  44.48 
 
 
721 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  45.29 
 
 
700 aa  547  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  44.75 
 
 
700 aa  543  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  45.29 
 
 
728 aa  545  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  43.73 
 
 
769 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  42.8 
 
 
731 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  44.46 
 
 
760 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  42.88 
 
 
720 aa  539  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  43.17 
 
 
736 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  42.67 
 
 
775 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  42.96 
 
 
731 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  43.85 
 
 
691 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  42.49 
 
 
696 aa  535  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  42.88 
 
 
736 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  42.35 
 
 
701 aa  538  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  42.55 
 
 
727 aa  535  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  43.45 
 
 
727 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  43.05 
 
 
727 aa  533  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  43.21 
 
 
736 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  43.02 
 
 
741 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0337  polyphosphate kinase  40.37 
 
 
747 aa  532  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  43.65 
 
 
747 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  43.65 
 
 
747 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  43.5 
 
 
746 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  44.36 
 
 
690 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  43 
 
 
736 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  42.67 
 
 
736 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  44.49 
 
 
754 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  41.64 
 
 
693 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  44.26 
 
 
712 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  44.3 
 
 
729 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  44.85 
 
 
744 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  43.35 
 
 
721 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  41.64 
 
 
707 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  43.88 
 
 
737 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  42.96 
 
 
708 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  42.34 
 
 
740 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  43.02 
 
 
713 aa  523  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  42.98 
 
 
724 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  43.43 
 
 
742 aa  525  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  43.91 
 
 
763 aa  525  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  39.8 
 
 
721 aa  520  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  42.16 
 
 
735 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  42.6 
 
 
688 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  41.33 
 
 
707 aa  519  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1578  polyphosphate kinase  41.99 
 
 
700 aa  521  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  43.93 
 
 
750 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  41.52 
 
 
743 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  41.41 
 
 
710 aa  521  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  41.27 
 
 
714 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  42.46 
 
 
746 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  44.48 
 
 
743 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  44.06 
 
 
702 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  42.43 
 
 
749 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  42.52 
 
 
882 aa  517  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  42.13 
 
 
691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  42.98 
 
 
733 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  44.34 
 
 
726 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  42.79 
 
 
734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  41.91 
 
 
731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  41.19 
 
 
712 aa  515  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  42.31 
 
 
734 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  41.95 
 
 
753 aa  515  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
801 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  42.06 
 
 
749 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  41.73 
 
 
709 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  42.31 
 
 
746 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  43.68 
 
 
745 aa  509  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  40.86 
 
 
693 aa  511  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  42.25 
 
 
764 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  41.69 
 
 
736 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  40.78 
 
 
759 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  42.26 
 
 
736 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  43.36 
 
 
721 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  42.07 
 
 
709 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>