298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2935 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  53.58 
 
 
708 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  50.93 
 
 
743 aa  665    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  51.53 
 
 
709 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  54.22 
 
 
708 aa  711    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  49.57 
 
 
708 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  48.01 
 
 
722 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  48.14 
 
 
736 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  51.79 
 
 
700 aa  646    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  51.01 
 
 
707 aa  663    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  52.04 
 
 
696 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  48.46 
 
 
707 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  48.1 
 
 
731 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  48.31 
 
 
720 aa  637    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  49.13 
 
 
715 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  50.21 
 
 
713 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  52.8 
 
 
700 aa  671    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  48.9 
 
 
695 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  51.95 
 
 
701 aa  659    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  100 
 
 
702 aa  1403    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  49.64 
 
 
713 aa  647    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  48.61 
 
 
717 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  48.48 
 
 
709 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  51.39 
 
 
743 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  48.01 
 
 
722 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  48.66 
 
 
721 aa  634  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  49.64 
 
 
714 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  48.77 
 
 
728 aa  629  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  48.67 
 
 
731 aa  631  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  46.43 
 
 
720 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  49.01 
 
 
729 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  47.86 
 
 
721 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  49.93 
 
 
728 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  49.85 
 
 
741 aa  609  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  49.49 
 
 
737 aa  610  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  48.44 
 
 
726 aa  609  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  47.78 
 
 
762 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  46.33 
 
 
726 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  46.76 
 
 
788 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  46.76 
 
 
788 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  46.98 
 
 
749 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  49.5 
 
 
742 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  49.5 
 
 
742 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  49.5 
 
 
742 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  48.48 
 
 
763 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  46.7 
 
 
750 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  47.05 
 
 
788 aa  598  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  49.13 
 
 
882 aa  597  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  50.29 
 
 
730 aa  598  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  46.95 
 
 
710 aa  595  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  48.2 
 
 
703 aa  594  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  44.44 
 
 
702 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  47.12 
 
 
745 aa  592  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  47.99 
 
 
744 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  46.38 
 
 
745 aa  592  1e-168  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  47.67 
 
 
714 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  48.4 
 
 
691 aa  591  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  48.49 
 
 
731 aa  592  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  47.99 
 
 
770 aa  590  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  46.88 
 
 
727 aa  591  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  46.2 
 
 
801 aa  591  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  45.57 
 
 
754 aa  592  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  48.43 
 
 
721 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  44.02 
 
 
702 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  45.13 
 
 
753 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  44.14 
 
 
739 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  47.89 
 
 
702 aa  588  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  47.31 
 
 
766 aa  588  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  44.57 
 
 
724 aa  585  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  45.2 
 
 
736 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  46.44 
 
 
693 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  44.02 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  44.02 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  44.02 
 
 
702 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  45.27 
 
 
734 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  47.56 
 
 
765 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  44.78 
 
 
713 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  44.02 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  44.02 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  46.91 
 
 
790 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  47.63 
 
 
769 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  45.42 
 
 
736 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  47.4 
 
 
749 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  43.87 
 
 
702 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  44.91 
 
 
736 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  45.76 
 
 
813 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  45.42 
 
 
734 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  47.92 
 
 
760 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  43.87 
 
 
700 aa  581  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  45.73 
 
 
712 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  48.47 
 
 
712 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  44.84 
 
 
736 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  44.62 
 
 
741 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  43.87 
 
 
702 aa  582  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  47.52 
 
 
749 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  47.89 
 
 
743 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  44.91 
 
 
731 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  49.24 
 
 
705 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  46.65 
 
 
754 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  43.9 
 
 
681 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1870  polyphosphate kinase  48.24 
 
 
694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>