299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2235 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  47.5 
 
 
721 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  76.76 
 
 
762 aa  1120    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  61.31 
 
 
770 aa  880    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  59.04 
 
 
738 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  65.4 
 
 
749 aa  942    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  56.65 
 
 
769 aa  781    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  100 
 
 
766 aa  1552    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  75.71 
 
 
744 aa  1106    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  79.07 
 
 
765 aa  1184    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  56.92 
 
 
743 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  66.17 
 
 
745 aa  962    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  57.43 
 
 
702 aa  806    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  48.47 
 
 
731 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  58.91 
 
 
693 aa  826    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  48.04 
 
 
736 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  74 
 
 
731 aa  1057    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  55.62 
 
 
703 aa  782    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  69.82 
 
 
721 aa  993    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  57.28 
 
 
763 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  50.69 
 
 
731 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  51.2 
 
 
722 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  62.06 
 
 
697 aa  868    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  59.75 
 
 
750 aa  825    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  58.71 
 
 
691 aa  797    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  56.36 
 
 
729 aa  796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  61.48 
 
 
705 aa  872    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  50.57 
 
 
721 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  50.29 
 
 
708 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  56.82 
 
 
728 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  65.13 
 
 
745 aa  937    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  51.89 
 
 
695 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  51.38 
 
 
726 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  56.06 
 
 
742 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  62.69 
 
 
687 aa  863    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  56.06 
 
 
742 aa  772    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  47.14 
 
 
720 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  58.37 
 
 
712 aa  771    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  56.07 
 
 
741 aa  761    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  65.26 
 
 
749 aa  951    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  49.16 
 
 
708 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  49.25 
 
 
714 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  56.96 
 
 
737 aa  788    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  63.01 
 
 
696 aa  871    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  56.06 
 
 
742 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  56.94 
 
 
730 aa  767    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  49.57 
 
 
882 aa  646    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  56.74 
 
 
760 aa  768    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  51.2 
 
 
722 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  48.94 
 
 
700 aa  635    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  45.11 
 
 
705 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  46.47 
 
 
712 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  47.53 
 
 
743 aa  616  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  45.67 
 
 
712 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  45.27 
 
 
707 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  45.5 
 
 
713 aa  615  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  45.34 
 
 
709 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  43.79 
 
 
709 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  43.65 
 
 
709 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  47.84 
 
 
729 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  44.28 
 
 
692 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  44.7 
 
 
709 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  43.33 
 
 
692 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  43.91 
 
 
694 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  45.85 
 
 
713 aa  600  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  45.92 
 
 
701 aa  601  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  43.71 
 
 
713 aa  599  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  44.91 
 
 
707 aa  595  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  44.33 
 
 
708 aa  594  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  46.43 
 
 
696 aa  591  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  43.06 
 
 
692 aa  592  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  46.81 
 
 
736 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  44.1 
 
 
720 aa  586  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0133  polyphosphate kinase  45.85 
 
 
728 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0848217  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  47.31 
 
 
702 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  45.47 
 
 
734 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  46.23 
 
 
743 aa  582  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  46.81 
 
 
742 aa  582  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  46.75 
 
 
700 aa  581  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  44.49 
 
 
715 aa  581  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3323  polyphosphate kinase  45.82 
 
 
727 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  47.2 
 
 
788 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  47.94 
 
 
750 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  45.66 
 
 
731 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  47.2 
 
 
788 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  45.2 
 
 
734 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  46.89 
 
 
727 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  47.42 
 
 
749 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  45.38 
 
 
717 aa  571  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  47.2 
 
 
788 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  46.9 
 
 
790 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  45.52 
 
 
759 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  45.43 
 
 
736 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  46.06 
 
 
746 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  45.93 
 
 
735 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  46.96 
 
 
727 aa  568  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  43.95 
 
 
712 aa  567  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  46.48 
 
 
728 aa  568  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  46.29 
 
 
753 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  45.92 
 
 
726 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  43.43 
 
 
702 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>