298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0494 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  68.23 
 
 
764 aa  986    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  87.52 
 
 
788 aa  1295    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  59.88 
 
 
727 aa  827    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  71.21 
 
 
801 aa  1037    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  61.64 
 
 
742 aa  864    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  68.09 
 
 
746 aa  977    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  59.07 
 
 
764 aa  827    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  64.63 
 
 
734 aa  925    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  67.94 
 
 
746 aa  974    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  69.69 
 
 
731 aa  1014    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  59.17 
 
 
724 aa  808    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  69.05 
 
 
733 aa  1015    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  72.35 
 
 
726 aa  1065    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  49.5 
 
 
708 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  59.2 
 
 
728 aa  810    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  63.01 
 
 
736 aa  931    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  69.74 
 
 
736 aa  1016    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  60.35 
 
 
754 aa  870    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  70.39 
 
 
733 aa  1029    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  60.43 
 
 
724 aa  835    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  68.47 
 
 
813 aa  1031    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  71.02 
 
 
736 aa  1025    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  66.14 
 
 
735 aa  920    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  69.18 
 
 
759 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  69.11 
 
 
741 aa  1008    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  86.92 
 
 
750 aa  1258    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  66.67 
 
 
736 aa  948    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  58.9 
 
 
722 aa  822    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  62.55 
 
 
753 aa  927    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  67.04 
 
 
754 aa  969    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  64.63 
 
 
734 aa  925    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  61.95 
 
 
724 aa  902    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  59.34 
 
 
728 aa  813    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  59.28 
 
 
721 aa  793    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  100 
 
 
790 aa  1599    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  60.31 
 
 
721 aa  833    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  59.52 
 
 
729 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  85.28 
 
 
749 aa  1255    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  87.52 
 
 
788 aa  1295    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  87.85 
 
 
788 aa  1290    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  48.55 
 
 
743 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  45.62 
 
 
731 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  48.53 
 
 
700 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  48.49 
 
 
708 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  46.09 
 
 
722 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  46.09 
 
 
722 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  44.79 
 
 
721 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
731 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  47.07 
 
 
695 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  48.15 
 
 
710 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  48.74 
 
 
745 aa  597  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  46.88 
 
 
745 aa  595  1e-168  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  48.64 
 
 
727 aa  594  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  48.44 
 
 
762 aa  595  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  46.01 
 
 
709 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  44.48 
 
 
736 aa  592  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  46.02 
 
 
765 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  48.37 
 
 
712 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  46.91 
 
 
702 aa  588  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  44.73 
 
 
720 aa  588  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  47.81 
 
 
749 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  46.67 
 
 
700 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  45.17 
 
 
707 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  47.29 
 
 
749 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  47.62 
 
 
729 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  47.46 
 
 
691 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  47.68 
 
 
687 aa  582  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  46.42 
 
 
707 aa  579  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  46.9 
 
 
766 aa  581  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  45.01 
 
 
713 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  47.67 
 
 
744 aa  582  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  47.16 
 
 
721 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  47.21 
 
 
715 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  44.9 
 
 
709 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  45.69 
 
 
693 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  44.85 
 
 
712 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  46.47 
 
 
743 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  45.11 
 
 
714 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  48.44 
 
 
705 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  46.67 
 
 
760 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  45.08 
 
 
713 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  47.12 
 
 
763 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  44.54 
 
 
721 aa  575  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  44.14 
 
 
775 aa  571  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  46.88 
 
 
882 aa  571  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  42.98 
 
 
713 aa  571  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  47.14 
 
 
697 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  45.14 
 
 
770 aa  565  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  45.66 
 
 
728 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  47.25 
 
 
731 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  43.74 
 
 
769 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  47.44 
 
 
730 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  47.56 
 
 
702 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  46.93 
 
 
688 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  44.96 
 
 
696 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.18 
 
 
709 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  47.86 
 
 
750 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  45.29 
 
 
720 aa  561  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  44.78 
 
 
715 aa  559  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  47.82 
 
 
696 aa  561  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>