298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3127 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  65.88 
 
 
736 aa  982    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  71.63 
 
 
736 aa  1050    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  62.32 
 
 
721 aa  852    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  68.7 
 
 
746 aa  996    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  100 
 
 
726 aa  1474    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  66.34 
 
 
753 aa  976    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  76.49 
 
 
750 aa  1083    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  63 
 
 
742 aa  891    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  74.22 
 
 
788 aa  1058    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  76.77 
 
 
749 aa  1088    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  71.39 
 
 
733 aa  1048    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  59.01 
 
 
724 aa  813    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  66.67 
 
 
734 aa  972    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  60.03 
 
 
728 aa  813    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  66.81 
 
 
734 aa  976    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  72.03 
 
 
801 aa  1054    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  62.86 
 
 
754 aa  873    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  71.31 
 
 
733 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  59.01 
 
 
724 aa  810    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  70.26 
 
 
736 aa  1041    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  59.52 
 
 
727 aa  838    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  70.76 
 
 
759 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  71.43 
 
 
741 aa  1046    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  69.08 
 
 
764 aa  999    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  72.3 
 
 
731 aa  1056    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  60.43 
 
 
722 aa  840    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  66.16 
 
 
754 aa  977    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  60.17 
 
 
728 aa  816    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  62.57 
 
 
724 aa  909    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  74.65 
 
 
788 aa  1071    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  66.39 
 
 
736 aa  966    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  74.65 
 
 
788 aa  1071    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  73.76 
 
 
813 aa  1061    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  67.32 
 
 
735 aa  948    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  59.32 
 
 
721 aa  805    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  68.56 
 
 
746 aa  992    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  61.86 
 
 
764 aa  856    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  60.2 
 
 
729 aa  805    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  73.37 
 
 
790 aa  1046    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  47.84 
 
 
708 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  46.33 
 
 
702 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  47.4 
 
 
708 aa  602  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  47.64 
 
 
700 aa  591  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  45.39 
 
 
731 aa  589  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  45.28 
 
 
721 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  47.17 
 
 
700 aa  588  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  48.15 
 
 
745 aa  588  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  47.38 
 
 
721 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  45.97 
 
 
743 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  44.56 
 
 
695 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  46.77 
 
 
762 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  44.57 
 
 
713 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  46.88 
 
 
745 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  46.13 
 
 
744 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  44.52 
 
 
713 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  45.39 
 
 
765 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
722 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  44.89 
 
 
736 aa  569  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  45.04 
 
 
707 aa  572  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  43.93 
 
 
707 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  47.53 
 
 
749 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  46.23 
 
 
712 aa  571  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
722 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  44.95 
 
 
720 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  44.64 
 
 
709 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  46.32 
 
 
697 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  43.96 
 
 
731 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  45.49 
 
 
712 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  46.93 
 
 
691 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  43.86 
 
 
709 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  47.56 
 
 
749 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  45.92 
 
 
766 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  45.78 
 
 
729 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  46.3 
 
 
743 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  42.9 
 
 
696 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  45.38 
 
 
728 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  46.88 
 
 
763 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  47.37 
 
 
727 aa  558  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  45.23 
 
 
693 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  45.51 
 
 
687 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  43.54 
 
 
720 aa  555  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  44.59 
 
 
721 aa  556  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  44.62 
 
 
714 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  46.29 
 
 
696 aa  558  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  46.16 
 
 
714 aa  555  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  45.93 
 
 
731 aa  552  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  46.7 
 
 
702 aa  555  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  43.54 
 
 
775 aa  552  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  43.45 
 
 
701 aa  553  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  43.12 
 
 
713 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  46.15 
 
 
742 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  43.9 
 
 
743 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  43.09 
 
 
709 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  45.73 
 
 
688 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  44.05 
 
 
882 aa  545  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  44.08 
 
 
715 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  44.03 
 
 
708 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  46.15 
 
 
742 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  46.15 
 
 
742 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  45.52 
 
 
750 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>