299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3618 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  62.67 
 
 		 705 aa  807    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  65.06 
 
 		 769 aa  874    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  63.46 
 
 		 729 aa  864    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  67.34 
 
 		 712 aa  895    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  56.13 
 
 		 749 aa  782    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  60.45 
 
 		 731 aa  815    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  56.03 
 
 		 703 aa  747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  58.22 
 
 		 762 aa  783    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  63.31 
 
 		 741 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  51.19 
 
 		 708 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  64.66 
 
 		 743 aa  847    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  59.86 
 
 		 702 aa  794    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  52.3 
 
 		 731 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  51.21 
 
 		 721 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  53.05 
 
 		 736 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  52.08 
 
 		 708 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  51.53 
 
 		 731 aa  668    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  51.99 
 
 		 714 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  51.52 
 
 		 882 aa  642    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  53.97 
 
 		 745 aa  765    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  100 
 
 		 750 aa  1522    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  52.22 
 
 		 722 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  55.63 
 
 		 770 aa  747    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  51.46 
 
 		 721 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  59.83 
 
 		 766 aa  821    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  63.33 
 
 		 763 aa  850    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  65.48 
 
 		 728 aa  898    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  66.81 
 
 		 691 aa  908    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  58.49 
 
 		 693 aa  764    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  62.74 
 
 		 687 aa  809    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  59.19 
 
 		 765 aa  813    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  64.54 
 
 		 742 aa  845    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  49.64 
 
 		 720 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  59.71 
 
 		 697 aa  781    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  62.95 
 
 		 721 aa  838    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  55.8 
 
 		 745 aa  765    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  56.4 
 
 		 749 aa  787    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  65.41 
 
 		 760 aa  867    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  61.08 
 
 		 744 aa  820    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  52.22 
 
 		 722 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  85.64 
 
 		 738 aa  1212    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  60.2 
 
 		 696 aa  783    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  64.54 
 
 		 742 aa  845    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  64.54 
 
 		 742 aa  845    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  64.45 
 
 		 730 aa  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  64.07 
 
 		 737 aa  869    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  50.87 
 
 		 700 aa  628  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  50 
 
 		 695 aa  625  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  46.72 
 
 		 705 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  50.71 
 
 		 729 aa  618  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  44.84 
 
 		 692 aa  615  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  44.25 
 
 		 692 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  46.97 
 
 		 709 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  48.26 
 
 		 712 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  48.84 
 
 		 712 aa  611  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  46.92 
 
 		 713 aa  609  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  44.26 
 
 		 694 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  46.26 
 
 		 707 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  46.9 
 
 		 713 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  50.69 
 
 		 743 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  44.48 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  44.72 
 
 		 709 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  45.07 
 
 		 709 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  46.38 
 
 		 708 aa  601  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  47.49 
 
 		 701 aa  600  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  47.17 
 
 		 713 aa  599  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3323  polyphosphate kinase  48.12 
 
 		 727 aa  598  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  44.76 
 
 		 707 aa  596  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  47.24 
 
 		 715 aa  596  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1004  Polyphosphate kinase  51.52 
 
 		 689 aa  596  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.695447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0133  polyphosphate kinase  47.83 
 
 		 728 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0848217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  50 
 
 		 726 aa  593  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  46.87 
 
 		 823 aa  589  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  45.9 
 
 		 720 aa  591  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  45.8 
 
 		 709 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  48.6 
 
 		 743 aa  582  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  46.13 
 
 		 715 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  47.51 
 
 		 700 aa  575  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  47.44 
 
 		 728 aa  571  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3230  polyphosphate kinase  45.83 
 
 		 772 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  45.73 
 
 		 696 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1031  polyphosphate kinase  44.97 
 
 		 822 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  47.86 
 
 		 702 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  47.86 
 
 		 790 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  47.16 
 
 		 727 aa  561  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1780  Polyphosphate kinase  45.51 
 
 		 798 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316915  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  46.39 
 
 		 801 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  45.58 
 
 		 746 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2068  polyphosphate kinase  45.77 
 
 		 757 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  47.94 
 
 		 750 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  45.13 
 
 		 746 aa  554  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1795  polyphosphate kinase  44.55 
 
 		 828 aa  555  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0761388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  45.09 
 
 		 788 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  45.8 
 
 		 717 aa  549  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  44.51 
 
 		 693 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  45.21 
 
 		 764 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  46.84 
 
 		 749 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  45.52 
 
 		 726 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  45.09 
 
 		 788 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  45.04 
 
 		 724 aa  551  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>