299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8258 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  62.17 
 
 
766 aa  863    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  63.41 
 
 
687 aa  852    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  61.16 
 
 
749 aa  835    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  58.01 
 
 
763 aa  763    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  58.02 
 
 
712 aa  762    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  57.8 
 
 
741 aa  778    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  59.77 
 
 
769 aa  789    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  60.53 
 
 
702 aa  827    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  58.72 
 
 
738 aa  760    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  100 
 
 
697 aa  1406    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  58.74 
 
 
743 aa  767    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  57.55 
 
 
745 aa  790    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  49.2 
 
 
722 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  61.4 
 
 
693 aa  827    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  59.71 
 
 
750 aa  770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  62.91 
 
 
762 aa  869    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  57.77 
 
 
737 aa  784    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  49.57 
 
 
731 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  64.21 
 
 
744 aa  884    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  59.08 
 
 
728 aa  813    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  64.28 
 
 
705 aa  875    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  60.34 
 
 
703 aa  809    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  58.48 
 
 
742 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  58.48 
 
 
742 aa  774    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  60.83 
 
 
691 aa  821    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  64.14 
 
 
765 aa  903    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  60.64 
 
 
749 aa  828    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  65.46 
 
 
721 aa  889    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  49.2 
 
 
722 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  58.18 
 
 
745 aa  793    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  58.71 
 
 
729 aa  794    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  53.94 
 
 
882 aa  665    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  65.83 
 
 
696 aa  879    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  58.48 
 
 
742 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  61.14 
 
 
770 aa  830    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  59.13 
 
 
730 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  59.01 
 
 
760 aa  778    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  65.24 
 
 
731 aa  890    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  49.93 
 
 
731 aa  630  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  47.93 
 
 
721 aa  625  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  47.77 
 
 
721 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  49.14 
 
 
708 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  46.58 
 
 
736 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  47.59 
 
 
712 aa  617  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  48.76 
 
 
714 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  47.03 
 
 
713 aa  614  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  46.1 
 
 
720 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  47.24 
 
 
712 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1004  Polyphosphate kinase  51.43 
 
 
689 aa  593  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.695447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  48.89 
 
 
695 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  45.79 
 
 
743 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  46.75 
 
 
708 aa  586  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  43.79 
 
 
705 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  44.82 
 
 
709 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  48.29 
 
 
729 aa  581  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  43.17 
 
 
692 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.96 
 
 
709 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  49.4 
 
 
726 aa  576  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  42.82 
 
 
709 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  43.17 
 
 
692 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  43.88 
 
 
713 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  43.47 
 
 
694 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  46.32 
 
 
726 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  45.98 
 
 
700 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  44.2 
 
 
707 aa  566  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  47.75 
 
 
702 aa  566  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  43.48 
 
 
707 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  43.26 
 
 
692 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  47.95 
 
 
749 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  44.24 
 
 
715 aa  561  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  43.75 
 
 
713 aa  561  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  44.92 
 
 
823 aa  558  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1578  polyphosphate kinase  42.28 
 
 
700 aa  557  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  47.14 
 
 
790 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  46.01 
 
 
736 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  45.08 
 
 
700 aa  558  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  44.56 
 
 
701 aa  554  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  45.82 
 
 
753 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  46.1 
 
 
742 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  45.06 
 
 
710 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  45.88 
 
 
743 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  46.79 
 
 
727 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  44.68 
 
 
696 aa  554  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  47.36 
 
 
750 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  43.62 
 
 
709 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  46.38 
 
 
764 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  46.23 
 
 
746 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  45.84 
 
 
788 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  46.23 
 
 
746 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  45.1 
 
 
731 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  46.11 
 
 
801 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  45.84 
 
 
788 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  46.59 
 
 
734 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  45.44 
 
 
724 aa  551  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  46.28 
 
 
788 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  45.72 
 
 
735 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  43.89 
 
 
715 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  46.7 
 
 
728 aa  548  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  44.64 
 
 
688 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39859  predicted protein  44.26 
 
 
813 aa  546  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00638438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>