299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0740 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  74.17 
 
 		 728 aa  1085    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  55.65 
 
 		 721 aa  731    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  57.45 
 
 		 788 aa  809    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  60.58 
 
 		 735 aa  822    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  58.63 
 
 		 801 aa  807    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  57.31 
 
 		 746 aa  796    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  59.01 
 
 		 726 aa  823    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  56.82 
 
 		 742 aa  821    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  56.18 
 
 		 753 aa  785    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  57.45 
 
 		 788 aa  809    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  58.22 
 
 		 731 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  56.86 
 
 		 733 aa  791    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  56.52 
 
 		 734 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  57.74 
 
 		 750 aa  796    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  74.17 
 
 		 728 aa  1085    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  58.48 
 
 		 736 aa  804    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  56.12 
 
 		 736 aa  749    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  59.86 
 
 		 754 aa  822    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  58.48 
 
 		 733 aa  807    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  77.38 
 
 		 724 aa  1127    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  58.48 
 
 		 736 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  57.14 
 
 		 727 aa  790    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  58.21 
 
 		 759 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  56.07 
 
 		 764 aa  755    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  57.88 
 
 		 741 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  57.59 
 
 		 764 aa  797    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  57.59 
 
 		 788 aa  805    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  57.83 
 
 		 813 aa  808    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  53.56 
 
 		 722 aa  736    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  100 
 
 		 724 aa  1480    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  56.92 
 
 		 754 aa  791    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  57.61 
 
 		 749 aa  800    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  57.26 
 
 		 724 aa  805    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  57.16 
 
 		 746 aa  792    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  56.02 
 
 		 734 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  73.34 
 
 		 721 aa  1061    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  59.17 
 
 		 790 aa  811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  56.69 
 
 		 736 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  72.9 
 
 		 729 aa  1035    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  41.88 
 
 		 720 aa  565  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  45.78 
 
 		 766 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  42.43 
 
 		 721 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  41.94 
 
 		 736 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  42.92 
 
 		 722 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  42.92 
 
 		 722 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  43.95 
 
 		 745 aa  558  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  45.3 
 
 		 745 aa  556  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  44.15 
 
 		 693 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  42.22 
 
 		 731 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  45.51 
 
 		 762 aa  555  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  45.3 
 
 		 765 aa  555  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  42.3 
 
 		 721 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  43.95 
 
 		 744 aa  548  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  44.9 
 
 		 708 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  43.06 
 
 		 731 aa  547  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  45.8 
 
 		 727 aa  546  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  44.48 
 
 		 729 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  45.98 
 
 		 763 aa  539  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  43.32 
 
 		 710 aa  541  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  44.25 
 
 		 749 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  43.65 
 
 		 721 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  42.65 
 
 		 694 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  43.42 
 
 		 731 aa  532  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  43.62 
 
 		 690 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  42.98 
 
 		 714 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  42.71 
 
 		 695 aa  534  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  44.78 
 
 		 697 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  44.04 
 
 		 707 aa  531  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  44.2 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  42.67 
 
 		 700 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  43.54 
 
 		 705 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  44.15 
 
 		 702 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  45.03 
 
 		 696 aa  531  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  42.16 
 
 		 743 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  44.13 
 
 		 770 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  43.12 
 
 		 712 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  41.76 
 
 		 713 aa  528  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  44.93 
 
 		 687 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  43.59 
 
 		 712 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  43.45 
 
 		 688 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  42.61 
 
 		 712 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  43 
 
 		 749 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  41.61 
 
 		 739 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  41.1 
 
 		 707 aa  522  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.61 
 
 		 708 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  40.61 
 
 		 693 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  43.74 
 
 		 742 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  43.67 
 
 		 702 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  42.43 
 
 		 712 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  43.03 
 
 		 690 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  43.74 
 
 		 742 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  42.71 
 
 		 709 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  43.95 
 
 		 741 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  43.74 
 
 		 742 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  44.49 
 
 		 730 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  43.07 
 
 		 760 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  40.52 
 
 		 709 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  40.65 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  40.52 
 
 		 709 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  39.63 
 
 		 705 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>