298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1754 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  56.96 
 
 
734 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  56.82 
 
 
734 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  60.35 
 
 
726 aa  850    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  55.79 
 
 
742 aa  804    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  58.28 
 
 
746 aa  820    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  58.03 
 
 
801 aa  822    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  58.9 
 
 
790 aa  820    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  58.7 
 
 
764 aa  804    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  58.43 
 
 
764 aa  826    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  60 
 
 
735 aa  840    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  59.16 
 
 
733 aa  830    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  59.91 
 
 
750 aa  817    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  59.42 
 
 
788 aa  822    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  60.64 
 
 
749 aa  825    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  55.67 
 
 
728 aa  755    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  58.14 
 
 
746 aa  818    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  58.45 
 
 
754 aa  818    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  59.31 
 
 
733 aa  836    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  55.14 
 
 
724 aa  768    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  59.28 
 
 
788 aa  821    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  59.02 
 
 
736 aa  831    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  59.97 
 
 
731 aa  833    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  58.32 
 
 
759 aa  824    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  53.56 
 
 
724 aa  740    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  59.16 
 
 
741 aa  822    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  58.49 
 
 
736 aa  810    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  58.87 
 
 
736 aa  827    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  100 
 
 
722 aa  1470    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  57.38 
 
 
813 aa  828    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  58.49 
 
 
754 aa  832    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  55.81 
 
 
728 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  56.73 
 
 
724 aa  822    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  59.28 
 
 
788 aa  821    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  53.5 
 
 
721 aa  743    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  58.06 
 
 
736 aa  803    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  56.89 
 
 
753 aa  808    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  56.68 
 
 
727 aa  803    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  56.17 
 
 
729 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  68.69 
 
 
721 aa  962    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  45.47 
 
 
708 aa  586  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  44.48 
 
 
722 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  44.48 
 
 
722 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  44.4 
 
 
700 aa  571  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  41.24 
 
 
720 aa  567  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  45.61 
 
 
708 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  43.96 
 
 
736 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  44.04 
 
 
695 aa  561  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  43.7 
 
 
721 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  44.13 
 
 
731 aa  558  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  43.66 
 
 
731 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  43.75 
 
 
744 aa  552  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  46.1 
 
 
690 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  43.26 
 
 
707 aa  551  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  43.44 
 
 
720 aa  548  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
765 aa  547  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  45.12 
 
 
721 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  45.07 
 
 
727 aa  546  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  43.06 
 
 
721 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  43.55 
 
 
743 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  42.24 
 
 
715 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  45.64 
 
 
691 aa  545  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  45.04 
 
 
745 aa  542  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  44.01 
 
 
712 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  44.48 
 
 
693 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  44.15 
 
 
745 aa  536  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43.78 
 
 
714 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  44.57 
 
 
762 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  44.04 
 
 
749 aa  538  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  42.38 
 
 
707 aa  534  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  41.91 
 
 
700 aa  535  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  43.76 
 
 
728 aa  535  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  42.24 
 
 
713 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  42.4 
 
 
709 aa  535  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  42.26 
 
 
713 aa  529  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  44.01 
 
 
710 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  43.35 
 
 
701 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  42.82 
 
 
696 aa  532  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  44.34 
 
 
729 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  43.35 
 
 
882 aa  529  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  42.34 
 
 
743 aa  530  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  43.51 
 
 
743 aa  528  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  40.4 
 
 
705 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  43.98 
 
 
703 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  41.76 
 
 
713 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  41.31 
 
 
709 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  44.86 
 
 
726 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  42.23 
 
 
702 aa  528  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  42.82 
 
 
766 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  43.94 
 
 
749 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  41.47 
 
 
708 aa  528  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  43.77 
 
 
731 aa  525  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  44.3 
 
 
750 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  42.58 
 
 
693 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  44.41 
 
 
693 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  42.46 
 
 
705 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  43.58 
 
 
687 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  43.42 
 
 
702 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  42.21 
 
 
712 aa  522  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  44.08 
 
 
688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  40.57 
 
 
681 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>