298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1302 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  76.4 
 
 		 728 aa  1102    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  62.09 
 
 		 735 aa  858    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  60.14 
 
 		 801 aa  811    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  56.88 
 
 		 746 aa  781    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  58.56 
 
 		 750 aa  799    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  59.66 
 
 		 742 aa  833    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  58.74 
 
 		 813 aa  814    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  58.56 
 
 		 749 aa  800    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  73.34 
 
 		 724 aa  1082    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  57.7 
 
 		 733 aa  799    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  59.13 
 
 		 736 aa  819    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  55.01 
 
 		 734 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  76.4 
 
 		 728 aa  1103    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  57.06 
 
 		 764 aa  771    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  59.32 
 
 		 726 aa  825    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  55.54 
 
 		 736 aa  729    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  59.57 
 
 		 754 aa  823    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  59.34 
 
 		 733 aa  821    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  72.24 
 
 		 724 aa  1059    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  59.05 
 
 		 736 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  58.09 
 
 		 731 aa  814    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  59.08 
 
 		 759 aa  810    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  58.33 
 
 		 741 aa  802    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  56.74 
 
 		 746 aa  777    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  53.5 
 
 		 722 aa  743    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  55.43 
 
 		 736 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  55.62 
 
 		 754 aa  781    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  57.33 
 
 		 788 aa  791    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  54.81 
 
 		 753 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  55.3 
 
 		 734 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  58.97 
 
 		 724 aa  847    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  57.33 
 
 		 788 aa  791    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  57.35 
 
 		 727 aa  795    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  59.28 
 
 		 790 aa  801    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  100 
 
 		 721 aa  1466    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  57.83 
 
 		 721 aa  755    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  57.84 
 
 		 788 aa  789    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  57.7 
 
 		 764 aa  783    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  75.21 
 
 		 729 aa  1067    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  44.85 
 
 		 722 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  45.31 
 
 		 731 aa  578  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  44.85 
 
 		 722 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  42.53 
 
 		 720 aa  569  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  43.68 
 
 		 731 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  46.13 
 
 		 762 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  46 
 
 		 766 aa  568  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  45.63 
 
 		 708 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  43.42 
 
 		 700 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  46.45 
 
 		 745 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  44.24 
 
 		 721 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  47.83 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  46.35 
 
 		 765 aa  561  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  45.68 
 
 		 702 aa  561  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  44.08 
 
 		 743 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  46.88 
 
 		 745 aa  558  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  43.62 
 
 		 736 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  45.07 
 
 		 707 aa  555  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  44.54 
 
 		 749 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  45.33 
 
 		 693 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  45.27 
 
 		 744 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  45.56 
 
 		 721 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  44.98 
 
 		 714 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  45.94 
 
 		 729 aa  545  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  45.96 
 
 		 727 aa  545  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  45.22 
 
 		 701 aa  544  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  44.3 
 
 		 729 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.46 
 
 		 708 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  47.12 
 
 		 763 aa  542  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  46.04 
 
 		 703 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  43.43 
 
 		 721 aa  541  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  42.56 
 
 		 695 aa  536  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  44.56 
 
 		 690 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  46.05 
 
 		 697 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  43.83 
 
 		 769 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  44.51 
 
 		 712 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  44.63 
 
 		 760 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  46.29 
 
 		 702 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  44.99 
 
 		 731 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  45.32 
 
 		 730 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  43.27 
 
 		 710 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  43.94 
 
 		 728 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  44.83 
 
 		 687 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  43.56 
 
 		 715 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  43.38 
 
 		 749 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  45.23 
 
 		 696 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  44.89 
 
 		 743 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  44.29 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  43.04 
 
 		 743 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  40.89 
 
 		 717 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  42.46 
 
 		 712 aa  528  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  45.18 
 
 		 750 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  45.2 
 
 		 726 aa  527  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  44.44 
 
 		 742 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  44.44 
 
 		 742 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  44.44 
 
 		 742 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  41.32 
 
 		 736 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  41.72 
 
 		 707 aa  525  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  41.33 
 
 		 720 aa  524  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  41.81 
 
 		 693 aa  524  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  41.13 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>