299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1098 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  55.27 
 
 
728 aa  759    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  59.2 
 
 
721 aa  796    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  58.49 
 
 
742 aa  828    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  86.63 
 
 
736 aa  1303    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  75.21 
 
 
746 aa  1106    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  75.36 
 
 
746 aa  1109    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  100 
 
 
734 aa  1508    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  56.52 
 
 
724 aa  773    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  64.49 
 
 
788 aa  925    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  65.43 
 
 
749 aa  929    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  64.81 
 
 
733 aa  952    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  55.27 
 
 
728 aa  760    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  65.61 
 
 
731 aa  964    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  64.3 
 
 
790 aa  913    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  65.03 
 
 
801 aa  939    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  63.14 
 
 
736 aa  890    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  60.58 
 
 
754 aa  830    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  66.1 
 
 
733 aa  967    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  56.32 
 
 
724 aa  782    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  65.4 
 
 
736 aa  953    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  66.81 
 
 
726 aa  976    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  64.3 
 
 
759 aa  948    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  59.77 
 
 
764 aa  833    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  64.23 
 
 
741 aa  953    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  64.65 
 
 
813 aa  934    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  89.03 
 
 
753 aa  1327    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  98.37 
 
 
734 aa  1486    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  65.58 
 
 
750 aa  924    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  56.96 
 
 
722 aa  796    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  65.12 
 
 
736 aa  962    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  74.64 
 
 
754 aa  1094    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  65.52 
 
 
735 aa  921    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  58.19 
 
 
724 aa  849    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  74.82 
 
 
764 aa  1103    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  55.3 
 
 
721 aa  745    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  64.35 
 
 
788 aa  924    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  64.35 
 
 
788 aa  924    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  56.4 
 
 
727 aa  795    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  55.14 
 
 
729 aa  741    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  46.83 
 
 
708 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  45.01 
 
 
720 aa  591  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  47.88 
 
 
721 aa  587  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  46.48 
 
 
695 aa  585  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  44.96 
 
 
721 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  45.53 
 
 
700 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  46.05 
 
 
765 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  48.4 
 
 
749 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  45.35 
 
 
745 aa  579  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  45.2 
 
 
766 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  46.3 
 
 
707 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  45.27 
 
 
702 aa  579  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  46.12 
 
 
744 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  47.11 
 
 
707 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  43.96 
 
 
731 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  44.7 
 
 
713 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  46.39 
 
 
709 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  45.04 
 
 
736 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  45.15 
 
 
731 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  47.56 
 
 
731 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  45.06 
 
 
722 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  45.82 
 
 
745 aa  570  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  45.06 
 
 
722 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  44.99 
 
 
762 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  45.31 
 
 
729 aa  571  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  43.39 
 
 
721 aa  565  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  44.65 
 
 
713 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  45.2 
 
 
749 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  44.52 
 
 
709 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  45 
 
 
708 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  45.83 
 
 
691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  44.22 
 
 
700 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.28 
 
 
709 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  43.69 
 
 
696 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  41.85 
 
 
709 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  45.48 
 
 
712 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  45.89 
 
 
705 aa  555  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  43.27 
 
 
712 aa  554  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  44.54 
 
 
701 aa  554  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  44.22 
 
 
708 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43.9 
 
 
714 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  45 
 
 
742 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  43.8 
 
 
770 aa  552  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  45.36 
 
 
702 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  45.98 
 
 
687 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  46.59 
 
 
697 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  45 
 
 
742 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  45 
 
 
742 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  46.54 
 
 
730 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  43.96 
 
 
769 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  42.45 
 
 
717 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  43.19 
 
 
693 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  46.36 
 
 
727 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  43.23 
 
 
743 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  43.85 
 
 
743 aa  543  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  41.5 
 
 
705 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  44.44 
 
 
760 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  45.21 
 
 
741 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  42.14 
 
 
692 aa  542  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  41.83 
 
 
694 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  41.95 
 
 
692 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>