298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1636 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  100 
 
 
684 aa  1389    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  46.44 
 
 
701 aa  614  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  45.49 
 
 
692 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  44.71 
 
 
696 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  45.15 
 
 
709 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  42.88 
 
 
718 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
701 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  43.05 
 
 
689 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  42.29 
 
 
730 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  42.02 
 
 
686 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  42.9 
 
 
690 aa  561  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  41.85 
 
 
700 aa  560  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  42.46 
 
 
689 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  42.58 
 
 
724 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  43.05 
 
 
690 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  41.75 
 
 
688 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  41.79 
 
 
720 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  42.02 
 
 
723 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  42.02 
 
 
723 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  42.02 
 
 
723 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  41.64 
 
 
720 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  41.64 
 
 
720 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  42.24 
 
 
722 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  42.02 
 
 
723 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  41.73 
 
 
720 aa  548  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  42.13 
 
 
688 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  42.13 
 
 
688 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  41.87 
 
 
687 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  42.13 
 
 
688 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  42.13 
 
 
688 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  42.13 
 
 
688 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  41.04 
 
 
694 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  41.14 
 
 
687 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  41.14 
 
 
687 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  41.14 
 
 
687 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  41.06 
 
 
690 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  39.24 
 
 
690 aa  494  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  39.68 
 
 
695 aa  488  1e-136  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  39.53 
 
 
695 aa  471  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  39.42 
 
 
687 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  39.35 
 
 
679 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  38.4 
 
 
736 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  37.09 
 
 
721 aa  442  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  39.76 
 
 
659 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  38.12 
 
 
702 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  38.12 
 
 
702 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  38.12 
 
 
702 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  38.12 
 
 
702 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  36.06 
 
 
707 aa  432  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  37.94 
 
 
702 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  38.12 
 
 
702 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  38.12 
 
 
702 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  36.8 
 
 
710 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  37.7 
 
 
673 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  37.94 
 
 
700 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  36.6 
 
 
709 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  36.67 
 
 
743 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  34.75 
 
 
708 aa  425  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  36.54 
 
 
713 aa  425  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  37.27 
 
 
715 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  36.07 
 
 
722 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  35.58 
 
 
681 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  36.07 
 
 
722 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  36.6 
 
 
696 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  35.57 
 
 
731 aa  422  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  37.25 
 
 
702 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  37.22 
 
 
720 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  35.75 
 
 
708 aa  422  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  37.57 
 
 
702 aa  422  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  37.94 
 
 
721 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  34.24 
 
 
714 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  35.61 
 
 
720 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  34.95 
 
 
731 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0494  polyphosphate kinase  35.46 
 
 
728 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  34.79 
 
 
707 aa  412  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  36.88 
 
 
736 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  36.73 
 
 
736 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  35.79 
 
 
709 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  36.98 
 
 
747 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  36.98 
 
 
727 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  34.91 
 
 
688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  33.92 
 
 
713 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  36.98 
 
 
747 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  34.61 
 
 
721 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  36.73 
 
 
746 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  37.71 
 
 
712 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01710  polyphosphate kinase  35.98 
 
 
1099 aa  405  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.249117  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  35.75 
 
 
741 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  35.6 
 
 
705 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  35.12 
 
 
715 aa  405  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  35.1 
 
 
743 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  35.62 
 
 
729 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>