298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1578 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0727  polyphosphate kinase  56.47 
 
 
697 aa  820    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1334  polyphosphate kinase  57.83 
 
 
697 aa  826    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117198  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1548  polyphosphate kinase  59.53 
 
 
694 aa  848    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1724  polyphosphate kinase  58.36 
 
 
696 aa  832    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1578  polyphosphate kinase  100 
 
 
700 aa  1436    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0339  polyphosphate kinase  60.12 
 
 
694 aa  856    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.984147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1603  Polyphosphate kinase  59.48 
 
 
705 aa  849    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1022  polyphosphate kinase  58.7 
 
 
697 aa  830    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.665381  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0875  polyphosphate kinase  57.25 
 
 
696 aa  834    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.458341  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1361  polyphosphate kinase  59.68 
 
 
694 aa  850    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  44.72 
 
 
708 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  43.99 
 
 
721 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  44.04 
 
 
722 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  44.04 
 
 
722 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.35 
 
 
708 aa  595  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43.48 
 
 
714 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  43.24 
 
 
721 aa  588  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  44.93 
 
 
702 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  40.55 
 
 
731 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  46.21 
 
 
709 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  45.83 
 
 
702 aa  588  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  44.78 
 
 
700 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  44.78 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  44.78 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  44.78 
 
 
702 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  44.78 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  44.21 
 
 
707 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  44.78 
 
 
702 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  44.18 
 
 
695 aa  584  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  43.78 
 
 
713 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  45.66 
 
 
700 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  41.37 
 
 
736 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  45.02 
 
 
713 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  41.18 
 
 
731 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  43.6 
 
 
696 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  44.69 
 
 
702 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  44.86 
 
 
702 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  43.74 
 
 
709 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  41.58 
 
 
743 aa  568  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  41.16 
 
 
720 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  42.28 
 
 
697 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  42.58 
 
 
691 aa  568  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  42.63 
 
 
729 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  42.35 
 
 
729 aa  559  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  43.71 
 
 
708 aa  557  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  42 
 
 
702 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  44.1 
 
 
720 aa  555  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  43.12 
 
 
763 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  41.67 
 
 
713 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  42.13 
 
 
715 aa  554  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  42.66 
 
 
712 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  41.78 
 
 
702 aa  551  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  41.68 
 
 
701 aa  551  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  42.81 
 
 
692 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  41.31 
 
 
717 aa  547  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  43.22 
 
 
694 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  40.44 
 
 
882 aa  542  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  42.41 
 
 
700 aa  543  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  39.62 
 
 
743 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  41.73 
 
 
710 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  41.58 
 
 
728 aa  544  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  41.45 
 
 
754 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  40.37 
 
 
741 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  41.94 
 
 
730 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  42.26 
 
 
742 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  40.62 
 
 
707 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  40.18 
 
 
737 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  42.26 
 
 
742 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  42.67 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  42.26 
 
 
742 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  40.85 
 
 
746 aa  538  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  41.99 
 
 
720 aa  538  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  42.8 
 
 
705 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  41.17 
 
 
712 aa  537  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  40.85 
 
 
746 aa  538  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  40.5 
 
 
715 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  40.64 
 
 
760 aa  535  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  41.83 
 
 
750 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  41.74 
 
 
712 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  40.94 
 
 
726 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  39.04 
 
 
753 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  40.79 
 
 
769 aa  532  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  38.9 
 
 
721 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  40.12 
 
 
703 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  38.44 
 
 
744 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  42.99 
 
 
741 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  41.74 
 
 
712 aa  531  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  43.29 
 
 
747 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  43.29 
 
 
746 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  39.83 
 
 
764 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  41.3 
 
 
735 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  40.62 
 
 
754 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  40.72 
 
 
726 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  42.26 
 
 
709 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  38.85 
 
 
762 aa  529  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  39.62 
 
 
766 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  41.96 
 
 
693 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  41.97 
 
 
709 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  42.07 
 
 
736 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  41.93 
 
 
736 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>