298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004381 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  66.47 
 
 
688 aa  978    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  66.47 
 
 
688 aa  978    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  91.52 
 
 
709 aa  1310    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  56.73 
 
 
723 aa  822    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  66.96 
 
 
687 aa  959    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  66.67 
 
 
689 aa  960    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  66.23 
 
 
686 aa  978    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  65.99 
 
 
689 aa  949    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  56.1 
 
 
720 aa  819    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  56.73 
 
 
723 aa  822    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  81.69 
 
 
701 aa  1188    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  65.99 
 
 
690 aa  945    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  66.47 
 
 
688 aa  978    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  66.62 
 
 
688 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  66.62 
 
 
688 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  66.47 
 
 
688 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  66.47 
 
 
688 aa  978    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  56.73 
 
 
723 aa  822    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  66.47 
 
 
688 aa  978    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  66.62 
 
 
688 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  100 
 
 
696 aa  1435    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  51.67 
 
 
695 aa  746    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  56.73 
 
 
723 aa  822    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  66.96 
 
 
687 aa  959    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  54.34 
 
 
694 aa  779    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  66.96 
 
 
687 aa  959    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  55.94 
 
 
720 aa  821    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  56.09 
 
 
720 aa  825    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  66.57 
 
 
690 aa  956    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  55.6 
 
 
690 aa  778    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  66.62 
 
 
688 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  56.23 
 
 
720 aa  827    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  66.47 
 
 
688 aa  978    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  55.78 
 
 
730 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  66.47 
 
 
688 aa  978    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  78.49 
 
 
722 aa  1139    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  66.33 
 
 
688 aa  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  56.12 
 
 
724 aa  820    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  67.98 
 
 
687 aa  970    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  66.47 
 
 
688 aa  978    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  46.05 
 
 
701 aa  627  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  44.71 
 
 
684 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  44.13 
 
 
700 aa  587  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  43.77 
 
 
718 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  42.38 
 
 
692 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  39.14 
 
 
690 aa  479  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  36.96 
 
 
695 aa  449  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  37.57 
 
 
687 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  38.67 
 
 
720 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  37.16 
 
 
715 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  35.24 
 
 
712 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  37.56 
 
 
882 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  36.36 
 
 
720 aa  434  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  36.34 
 
 
681 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  36.32 
 
 
715 aa  436  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  38.56 
 
 
693 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  37.63 
 
 
679 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  36.61 
 
 
700 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  36.89 
 
 
708 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  36.16 
 
 
722 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  36.16 
 
 
722 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  36.72 
 
 
693 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  38.01 
 
 
688 aa  422  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  36.12 
 
 
731 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  37.37 
 
 
712 aa  418  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  35.37 
 
 
702 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  36.67 
 
 
713 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  36.17 
 
 
727 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  36.66 
 
 
724 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  36.02 
 
 
710 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  35.31 
 
 
712 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  34.58 
 
 
713 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  34.72 
 
 
726 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  35.1 
 
 
721 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
702 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
702 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
702 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  35.39 
 
 
728 aa  412  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
702 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  35.38 
 
 
691 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  34.31 
 
 
736 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  34.79 
 
 
693 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  36.68 
 
 
693 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
702 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  36.09 
 
 
720 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  34.16 
 
 
736 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  36.32 
 
 
729 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  34.68 
 
 
744 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
700 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  34.23 
 
 
702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  37.09 
 
 
700 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  34.75 
 
 
696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  34.78 
 
 
742 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  35.5 
 
 
709 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  36.01 
 
 
731 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  35.98 
 
 
708 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  33.85 
 
 
710 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  35.56 
 
 
743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  36.02 
 
 
709 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  35.44 
 
 
690 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>