298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2284 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  53 
 
 		 688 aa  779    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  53 
 
 		 688 aa  779    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  53.4 
 
 		 687 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  94.17 
 
 		 720 aa  1415    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  56.09 
 
 		 696 aa  825    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  52.86 
 
 		 688 aa  776    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  93.5 
 
 		 723 aa  1403    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 690 aa  764    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  52.42 
 
 		 688 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  52.7 
 
 		 689 aa  760    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  52.85 
 
 		 689 aa  754    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  93.5 
 
 		 723 aa  1403    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  53 
 
 		 688 aa  779    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  52.42 
 
 		 688 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  55.06 
 
 		 701 aa  801    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  52.42 
 
 		 688 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 690 aa  763    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  54.44 
 
 		 687 aa  770    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  53 
 
 		 688 aa  779    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  80.29 
 
 		 724 aa  1209    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  46.58 
 
 		 695 aa  653    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  53 
 
 		 688 aa  779    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  51.81 
 
 		 690 aa  739    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  53 
 
 		 688 aa  779    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  93.5 
 
 		 723 aa  1402    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  53 
 
 		 688 aa  779    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  54.19 
 
 		 694 aa  773    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  53.4 
 
 		 687 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  99.86 
 
 		 720 aa  1488    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  100 
 
 		 720 aa  1492    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  53 
 
 		 688 aa  779    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  99.58 
 
 		 720 aa  1485    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  52.42 
 
 		 688 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  52.57 
 
 		 686 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  55.52 
 
 		 709 aa  811    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  80.7 
 
 		 730 aa  1223    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  53.4 
 
 		 687 aa  758    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  53.2 
 
 		 722 aa  778    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  93.36 
 
 		 723 aa  1402    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  52.42 
 
 		 688 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  44.16 
 
 		 701 aa  589  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  42.05 
 
 		 700 aa  560  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  41.64 
 
 		 684 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  42.44 
 
 		 692 aa  542  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  39.57 
 
 		 718 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  38.22 
 
 		 690 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  35.87 
 
 		 712 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  36.05 
 
 		 700 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  36.72 
 
 		 679 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  36.27 
 
 		 659 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  36.31 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  34.21 
 
 		 695 aa  408  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  34.04 
 
 		 715 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  34.24 
 
 		 722 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  34.24 
 
 		 722 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  34.21 
 
 		 700 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  34.06 
 
 		 702 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  34.06 
 
 		 702 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  34.06 
 
 		 702 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  34.06 
 
 		 702 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  34.92 
 
 		 731 aa  395  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  34.06 
 
 		 702 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  35.64 
 
 		 720 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  32.74 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  34.36 
 
 		 702 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  34.24 
 
 		 729 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  34.51 
 
 		 736 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  32.71 
 
 		 713 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  34.43 
 
 		 692 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  35.36 
 
 		 775 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  33.14 
 
 		 720 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  33.92 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  35.02 
 
 		 694 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  33.76 
 
 		 721 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  35.65 
 
 		 720 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  34.23 
 
 		 721 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  33.93 
 
 		 700 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  34.43 
 
 		 692 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  34.68 
 
 		 724 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  33.23 
 
 		 701 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  34.59 
 
 		 714 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  34.61 
 
 		 681 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  34.13 
 
 		 743 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  33.73 
 
 		 715 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  33.59 
 
 		 695 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  32.9 
 
 		 702 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  34.64 
 
 		 708 aa  382  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  34.13 
 
 		 727 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  33.09 
 
 		 731 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  31.79 
 
 		 726 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  33.33 
 
 		 702 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  32.54 
 
 		 737 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  32.83 
 
 		 728 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  34.07 
 
 		 713 aa  379  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  33.79 
 
 		 721 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  35.34 
 
 		 712 aa  379  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  33.64 
 
 		 709 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  34.04 
 
 		 730 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  32.93 
 
 		 709 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  35.46 
 
 		 726 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>