298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3685 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  100 
 
 
718 aa  1473    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  44.95 
 
 
701 aa  600  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  43.77 
 
 
696 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  43.79 
 
 
700 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  43.48 
 
 
692 aa  569  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  42.88 
 
 
684 aa  565  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  42.32 
 
 
709 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  42.73 
 
 
701 aa  547  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  40.82 
 
 
686 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.555438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
688 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  39.97 
 
 
722 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  40.17 
 
 
687 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  40.69 
 
 
730 aa  525  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  39.65 
 
 
690 aa  522  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  39.79 
 
 
689 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  40.09 
 
 
688 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  40.09 
 
 
688 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  40.09 
 
 
688 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  39.71 
 
 
689 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  40.09 
 
 
688 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  40.09 
 
 
688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  39.35 
 
 
690 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  39.71 
 
 
720 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  39.38 
 
 
724 aa  515  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  39.44 
 
 
687 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  39.44 
 
 
687 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  39.44 
 
 
687 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  39.57 
 
 
720 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  39.3 
 
 
723 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  39.57 
 
 
720 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  39.3 
 
 
723 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  39.42 
 
 
720 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  39.3 
 
 
723 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  39.3 
 
 
723 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  37 
 
 
694 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  38.09 
 
 
690 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  38.37 
 
 
687 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  36.6 
 
 
695 aa  455  1.0000000000000001e-126  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  35.95 
 
 
695 aa  437  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  36.56 
 
 
690 aa  438  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  35.91 
 
 
702 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  36.12 
 
 
721 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  37.11 
 
 
679 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  35.81 
 
 
702 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  36.87 
 
 
720 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  35.81 
 
 
700 aa  399  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  35.66 
 
 
702 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  35.66 
 
 
702 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  35.66 
 
 
702 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  35.49 
 
 
736 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  35.66 
 
 
702 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  35.66 
 
 
702 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  35.68 
 
 
681 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  36.08 
 
 
702 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  35.61 
 
 
715 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1603  Polyphosphate kinase  36.45 
 
 
705 aa  392  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  36.65 
 
 
731 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  36.14 
 
 
721 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1022  polyphosphate kinase  35.05 
 
 
697 aa  391  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.665381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  35.6 
 
 
700 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  35.81 
 
 
722 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  35.18 
 
 
712 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  34.29 
 
 
692 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1578  polyphosphate kinase  35.45 
 
 
700 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  35.81 
 
 
722 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  34.63 
 
 
659 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  35.77 
 
 
721 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  33.43 
 
 
709 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  34.25 
 
 
705 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  34.66 
 
 
720 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  35.28 
 
 
709 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  36.47 
 
 
712 aa  376  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  33.15 
 
 
709 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  34.94 
 
 
702 aa  379  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  33.86 
 
 
694 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  33.43 
 
 
692 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  34.86 
 
 
700 aa  379  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1548  polyphosphate kinase  34.31 
 
 
694 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  34.45 
 
 
731 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  33.43 
 
 
692 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  34.01 
 
 
715 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  35.14 
 
 
673 aa  376  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1361  polyphosphate kinase  34.31 
 
 
694 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1334  polyphosphate kinase  33.97 
 
 
697 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  34.87 
 
 
708 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  35.46 
 
 
743 aa  375  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0241  Polyphosphate kinase  31.7 
 
 
699 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.524479 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1724  polyphosphate kinase  34.74 
 
 
696 aa  372  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  35.67 
 
 
708 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0339  polyphosphate kinase  34.4 
 
 
694 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.984147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  34.06 
 
 
710 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  33.67 
 
 
712 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>