298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2480 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  100 
 
 
659 aa  1350    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  57.45 
 
 
679 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  50 
 
 
687 aa  598  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  41.33 
 
 
673 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  39.39 
 
 
695 aa  446  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0241  Polyphosphate kinase  37.84 
 
 
699 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.524479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  39.76 
 
 
684 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  37.39 
 
 
690 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  38.11 
 
 
724 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  37.26 
 
 
694 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  37.35 
 
 
688 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  37.41 
 
 
686 aa  415  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  36.42 
 
 
720 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  36.98 
 
 
730 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  36.34 
 
 
723 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  36.34 
 
 
723 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  36.19 
 
 
723 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  36.27 
 
 
720 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  36.19 
 
 
723 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  36.81 
 
 
720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  37.67 
 
 
692 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  36.27 
 
 
720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  36.05 
 
 
701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  36.01 
 
 
696 aa  405  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  36.6 
 
 
688 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  36.6 
 
 
688 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  36.6 
 
 
688 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  36.6 
 
 
688 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  36.6 
 
 
688 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  36.71 
 
 
687 aa  402  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  36.32 
 
 
701 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  36.09 
 
 
689 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  37.48 
 
 
708 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  36.04 
 
 
687 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  36.4 
 
 
690 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  36.04 
 
 
687 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  36.04 
 
 
687 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  37.85 
 
 
714 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  37.65 
 
 
710 aa  392  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  35.82 
 
 
690 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  36.63 
 
 
721 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  36.27 
 
 
709 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  36.19 
 
 
736 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  36.26 
 
 
690 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  36.39 
 
 
722 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  36.39 
 
 
722 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
731 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  34.63 
 
 
718 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  35.86 
 
 
689 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  37.04 
 
 
681 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  36.3 
 
 
743 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  34.96 
 
 
731 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  36.47 
 
 
736 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  36.52 
 
 
736 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  36.27 
 
 
702 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  35.43 
 
 
743 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  34.52 
 
 
721 aa  379  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  36.19 
 
 
720 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  36.5 
 
 
727 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  34.43 
 
 
722 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  35.42 
 
 
736 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  35.16 
 
 
736 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  34.55 
 
 
701 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  36.55 
 
 
708 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  35.19 
 
 
714 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  35.3 
 
 
702 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  35.3 
 
 
702 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  35.3 
 
 
702 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  35.3 
 
 
702 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  35.3 
 
 
702 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  35.3 
 
 
702 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  37.39 
 
 
700 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  35.68 
 
 
709 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  35.65 
 
 
721 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  35.7 
 
 
702 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  35.42 
 
 
741 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  35.69 
 
 
712 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  36.42 
 
 
740 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  35.51 
 
 
700 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  35.22 
 
 
712 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  35.4 
 
 
695 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  35.15 
 
 
700 aa  364  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  35.84 
 
 
693 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  34.95 
 
 
696 aa  363  6e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  35.05 
 
 
775 aa  363  6e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  35.77 
 
 
747 aa  363  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  35.15 
 
 
702 aa  363  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0938  polyphosphate kinase  33.9 
 
 
695 aa  362  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  35.37 
 
 
746 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1278  polyphosphate kinase  35.18 
 
 
687 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  35.81 
 
 
713 aa  362  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1307  polyphosphate kinase  35.18 
 
 
687 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>