298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2011 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 688 aa  772    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 688 aa  772    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  53.59 
 
 		 688 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  55.78 
 
 		 696 aa  815    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 688 aa  772    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  53.01 
 
 		 687 aa  746    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  53.01 
 
 		 687 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  80.67 
 
 		 723 aa  1213    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 688 aa  772    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  55.36 
 
 		 690 aa  773    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  53.59 
 
 		 688 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  53.59 
 
 		 688 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  81.74 
 
 		 720 aa  1221    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  53.88 
 
 		 688 aa  772    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  55.93 
 
 		 709 aa  803    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  87.2 
 
 		 724 aa  1300    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 688 aa  771    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  52.46 
 
 		 690 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  55.21 
 
 		 690 aa  770    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 688 aa  772    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  55.49 
 
 		 701 aa  790    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  46.85 
 
 		 695 aa  653    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  53.01 
 
 		 687 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  54.48 
 
 		 687 aa  760    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 688 aa  772    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  54.57 
 
 		 694 aa  771    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  80.56 
 
 		 720 aa  1219    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  80.7 
 
 		 720 aa  1223    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  80.67 
 
 		 723 aa  1213    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  53.59 
 
 		 688 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  80.42 
 
 		 720 aa  1219    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  83.09 
 
 		 723 aa  1213    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 688 aa  772    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  100 
 
 		 730 aa  1511    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  83.09 
 
 		 723 aa  1212    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  53.32 
 
 		 722 aa  772    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  54.33 
 
 		 689 aa  757    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  53.74 
 
 		 689 aa  754    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  53.74 
 
 		 686 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  53.59 
 
 		 688 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  44.59 
 
 		 701 aa  593  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  41.68 
 
 		 700 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  42.29 
 
 		 684 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  43.09 
 
 		 692 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  40.69 
 
 		 718 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  39.11 
 
 		 690 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  37.86 
 
 		 700 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  38.57 
 
 		 712 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  37.39 
 
 		 722 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  37.39 
 
 		 722 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  37.92 
 
 		 687 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  37.59 
 
 		 679 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  35.22 
 
 		 695 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  36.89 
 
 		 715 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  36.98 
 
 		 659 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  37.27 
 
 		 775 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  37.05 
 
 		 694 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  36.12 
 
 		 692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  36.23 
 
 		 731 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  35.25 
 
 		 702 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  37.3 
 
 		 721 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  35.11 
 
 		 700 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  35.25 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  35.25 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  35.25 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  34.96 
 
 		 702 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  37.54 
 
 		 714 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  36.35 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  35.25 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  35.66 
 
 		 700 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  36.76 
 
 		 713 aa  405  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  35.25 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  35.29 
 
 		 731 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  36.91 
 
 		 708 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  36.14 
 
 		 736 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  33.98 
 
 		 702 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  34.79 
 
 		 724 aa  402  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  37.06 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  36.04 
 
 		 709 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  33.7 
 
 		 721 aa  395  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  34.51 
 
 		 746 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  36.07 
 
 		 713 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  34.89 
 
 		 713 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  35.27 
 
 		 720 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  35.1 
 
 		 743 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  34.67 
 
 		 720 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  35.78 
 
 		 736 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  35.19 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  36.22 
 
 		 720 aa  391  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  33.38 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  36.21 
 
 		 709 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  34.37 
 
 		 746 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  35.69 
 
 		 721 aa  389  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  33.68 
 
 		 693 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  32.1 
 
 		 673 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  34.16 
 
 		 727 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  35.27 
 
 		 708 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  35.65 
 
 		 749 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  34.49 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  35.48 
 
 		 736 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>