298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1175 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  100 
 
 
688 aa  1406    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  100 
 
 
688 aa  1406    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  52.71 
 
 
723 aa  771    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  96.22 
 
 
688 aa  1328    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  99.85 
 
 
688 aa  1404    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  86.92 
 
 
687 aa  1213    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  100 
 
 
688 aa  1406    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  83.84 
 
 
690 aa  1159    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  96.08 
 
 
688 aa  1324    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  85.01 
 
 
689 aa  1176    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  82.36 
 
 
689 aa  1137    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  52.71 
 
 
723 aa  771    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  52.71 
 
 
723 aa  771    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  52.71 
 
 
723 aa  771    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  100 
 
 
688 aa  1406    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  100 
 
 
688 aa  1406    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  100 
 
 
688 aa  1406    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  100 
 
 
688 aa  1406    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  86.92 
 
 
687 aa  1213    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  100 
 
 
688 aa  1406    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  86.92 
 
 
687 aa  1213    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  88.06 
 
 
687 aa  1217    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  64.14 
 
 
701 aa  933    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  64.11 
 
 
695 aa  887    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  83.99 
 
 
690 aa  1160    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  66.47 
 
 
696 aa  978    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  96.22 
 
 
688 aa  1328    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  96.22 
 
 
688 aa  1328    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  53.85 
 
 
694 aa  756    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  51.96 
 
 
690 aa  728    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  52.86 
 
 
720 aa  775    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  53 
 
 
720 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  96.22 
 
 
688 aa  1328    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  66.33 
 
 
709 aa  962    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  53.15 
 
 
720 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  93.6 
 
 
686 aa  1325    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  53.88 
 
 
730 aa  772    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  62.3 
 
 
722 aa  892    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  52.71 
 
 
720 aa  769    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  54.17 
 
 
724 aa  778    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  42.7 
 
 
701 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  41.75 
 
 
684 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
700 aa  555  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  42.84 
 
 
692 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  39.97 
 
 
718 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  39.62 
 
 
690 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  37.66 
 
 
687 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  36.77 
 
 
715 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  36.85 
 
 
695 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  36.38 
 
 
736 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  37.29 
 
 
691 aa  422  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  36.23 
 
 
736 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  37.3 
 
 
679 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  37.35 
 
 
659 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  35.86 
 
 
722 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  35.84 
 
 
712 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  35.86 
 
 
722 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  36.38 
 
 
701 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  36.69 
 
 
700 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  36.3 
 
 
747 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  35.22 
 
 
736 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  35.8 
 
 
740 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  34.44 
 
 
702 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  35.77 
 
 
720 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  37.39 
 
 
724 aa  412  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  36 
 
 
721 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  36.15 
 
 
727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  35.31 
 
 
727 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  36.07 
 
 
693 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  35.02 
 
 
741 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  34.36 
 
 
721 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  35.7 
 
 
746 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  35.4 
 
 
882 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  35.56 
 
 
747 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  35.75 
 
 
721 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  35.29 
 
 
708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  35.54 
 
 
694 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  33.62 
 
 
702 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  36.83 
 
 
813 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  33.62 
 
 
702 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  33.62 
 
 
702 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  33.62 
 
 
702 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  35.39 
 
 
692 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  34.65 
 
 
731 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  33.76 
 
 
702 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  33.76 
 
 
700 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  34.98 
 
 
736 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  33.62 
 
 
702 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  34.98 
 
 
736 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  34.13 
 
 
692 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  35.71 
 
 
710 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  34.54 
 
 
681 aa  400  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  36.4 
 
 
714 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  36.18 
 
 
727 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  35.52 
 
 
736 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  33.76 
 
 
702 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  35.54 
 
 
688 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  35.2 
 
 
713 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  34.45 
 
 
691 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  34.45 
 
 
710 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>