297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2038 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  63.36 
 
 
700 aa  901    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  100 
 
 
701 aa  1440    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  60.29 
 
 
692 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  46.05 
 
 
696 aa  627  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  46.44 
 
 
684 aa  614  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  45.97 
 
 
709 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  44.95 
 
 
718 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  44.65 
 
 
724 aa  601  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  45.28 
 
 
701 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  45.59 
 
 
722 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  44.65 
 
 
730 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  44.08 
 
 
690 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  43.83 
 
 
694 aa  591  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  44.16 
 
 
720 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
723 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  44.43 
 
 
723 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
723 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  44.16 
 
 
720 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  42.37 
 
 
686 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  44.14 
 
 
720 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
723 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  43.78 
 
 
690 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  43.08 
 
 
689 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  43.94 
 
 
687 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  43.57 
 
 
720 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  43.24 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  43.49 
 
 
687 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  42.7 
 
 
688 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  43.49 
 
 
687 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  43.49 
 
 
687 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  42.55 
 
 
688 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  42.73 
 
 
690 aa  551  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  39.17 
 
 
695 aa  494  9.999999999999999e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  38.05 
 
 
690 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  38.21 
 
 
687 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  37.28 
 
 
702 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  36.08 
 
 
695 aa  439  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  37.16 
 
 
679 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  37.1 
 
 
702 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  36.82 
 
 
702 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  36.82 
 
 
702 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  36.82 
 
 
702 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  36.82 
 
 
702 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  36.82 
 
 
702 aa  429  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  36.82 
 
 
702 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  37.22 
 
 
715 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  36.53 
 
 
702 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  37.05 
 
 
700 aa  425  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  36.79 
 
 
720 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  35.98 
 
 
708 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1603  Polyphosphate kinase  36.56 
 
 
705 aa  421  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  34.2 
 
 
720 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  35.24 
 
 
727 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  34.37 
 
 
746 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  36.32 
 
 
722 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  36.32 
 
 
722 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  34.58 
 
 
710 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  33.99 
 
 
727 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  34.27 
 
 
746 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  36.05 
 
 
659 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  36.38 
 
 
775 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  36.11 
 
 
731 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  33.62 
 
 
681 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  36.06 
 
 
712 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  36.11 
 
 
715 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  35.35 
 
 
721 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0494  polyphosphate kinase  35.79 
 
 
728 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  35.65 
 
 
673 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  34.08 
 
 
743 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  34.79 
 
 
750 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  33.47 
 
 
764 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  35.88 
 
 
708 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  35.21 
 
 
702 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  35.05 
 
 
710 aa  402  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  34.87 
 
 
694 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  36.22 
 
 
700 aa  396  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  34.33 
 
 
749 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
726 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  34.91 
 
 
736 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  35.19 
 
 
754 aa  399  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  35.68 
 
 
736 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  34.47 
 
 
788 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  34.47 
 
 
788 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  35.54 
 
 
693 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  34.76 
 
 
736 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  34.81 
 
 
731 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  34.86 
 
 
736 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  36.14 
 
 
721 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>