298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3541 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  91.56 
 
 		 687 aa  1271    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  87.48 
 
 		 688 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  54.14 
 
 		 723 aa  776    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  54.14 
 
 		 723 aa  776    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  67.84 
 
 		 709 aa  961    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  86.01 
 
 		 690 aa  1178    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  100 
 
 		 687 aa  1405    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  91.56 
 
 		 687 aa  1271    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  54.14 
 
 		 723 aa  776    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  87.48 
 
 		 688 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  87.48 
 
 		 688 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  67.98 
 
 		 696 aa  990    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  84.13 
 
 		 689 aa  1162    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  91.56 
 
 		 687 aa  1271    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  54.24 
 
 		 720 aa  781    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  64.48 
 
 		 695 aa  886    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  88.06 
 
 		 688 aa  1246    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  86.46 
 
 		 689 aa  1196    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  55.6 
 
 		 694 aa  771    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  54.29 
 
 		 720 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  54.44 
 
 		 720 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  53.42 
 
 		 690 aa  735    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  54.59 
 
 		 720 aa  788    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  54.14 
 
 		 723 aa  776    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  87.48 
 
 		 688 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  54.48 
 
 		 730 aa  776    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  65.5 
 
 		 701 aa  938    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  62.91 
 
 		 722 aa  893    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  87.34 
 
 		 688 aa  1210    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  86.13 
 
 		 686 aa  1228    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  54.68 
 
 		 724 aa  790    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  86.3 
 
 		 690 aa  1179    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  43.94 
 
 		 701 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  43.56 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  41.87 
 
 		 684 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  43.59 
 
 		 692 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  40.17 
 
 		 718 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  40.38 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  38.2 
 
 		 715 aa  445  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  37.01 
 
 		 695 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  38.03 
 
 		 687 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  37.7 
 
 		 736 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  37.41 
 
 		 736 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  38.14 
 
 		 679 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  37.2 
 
 		 708 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  38.35 
 
 		 724 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  37.54 
 
 		 700 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  35.52 
 
 		 681 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  37.99 
 
 		 720 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  35.97 
 
 		 882 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  37.55 
 
 		 710 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  35.35 
 
 		 702 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  38.2 
 
 		 727 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  37.69 
 
 		 750 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  35.81 
 
 		 722 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  34.78 
 
 		 736 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  37.3 
 
 		 690 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  35.89 
 
 		 731 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  36.81 
 
 		 720 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  35.81 
 
 		 722 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  36.73 
 
 		 727 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  36.89 
 
 		 813 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  36.38 
 
 		 720 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  36.71 
 
 		 659 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  36.1 
 
 		 727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  35.85 
 
 		 700 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  35.7 
 
 		 702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  35.7 
 
 		 702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  35.7 
 
 		 702 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  35.44 
 
 		 736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  36.24 
 
 		 747 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  36.63 
 
 		 726 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  35.41 
 
 		 702 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  35.16 
 
 		 712 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  36.83 
 
 		 749 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  35.7 
 
 		 702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  35.7 
 
 		 702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  35.65 
 
 		 721 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  36.1 
 
 		 747 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  36.24 
 
 		 746 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  36.97 
 
 		 790 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  35.62 
 
 		 731 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  36.18 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  35.27 
 
 		 741 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  35.39 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  35.57 
 
 		 721 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  36.07 
 
 		 735 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  35.15 
 
 		 721 aa  402  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  35.38 
 
 		 736 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  35.88 
 
 		 733 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  35.41 
 
 		 740 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  35.27 
 
 		 731 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>