286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0878 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  86.06 
 
 		 422 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 413 aa  844    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  63.2 
 
 		 416 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  59.45 
 
 		 446 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.41 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  24.4 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  26.57 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.07 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.07 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  23.21 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  23.21 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  30.07 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  26.02 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.41 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  25.16 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  26.49 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.36 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.76 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.57 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  23.7 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.22 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  26.14 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.94 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  23.88 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.11 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  24.48 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.2 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  25.49 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  28.77 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  25.85 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  26.6 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  27.6 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.2 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.43 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  24.17 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.4 
 
 		 474 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  26.6 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  30.6 
 
 		 516 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  30.6 
 
 		 516 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  30.6 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  25.57 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  24.86 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  23.81 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.95 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  26.21 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.46 
 
 		 459 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.07 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  22.29 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  25.97 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  27.21 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.71 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.7 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  23.65 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  30.83 
 
 		 516 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  24.65 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  25.82 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  25.22 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  26.14 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.08 
 
 		 484 aa  53.1  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  23.9 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 		 467 aa  53.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  25.15 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.62 
 
 		 526 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  24.16 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  25.4 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  24.71 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  27.78 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  23.58 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.76 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  25.08 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  27.38 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  27.38 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  24.14 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  25.08 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  26.34 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  28.19 
 
 		 575 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  28.53 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  23.91 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  27.38 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  25.57 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  25.08 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  27.38 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  27.38 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.44 
 
 		 551 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  23.8 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  22.95 
 
 		 477 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  25.32 
 
 		 486 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  28.83 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  23.32 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  26.11 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  23.28 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  30.61 
 
 		 477 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  22.95 
 
 		 477 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  23.28 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  23.58 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  23.46 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>