157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2595 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
560 aa  1132    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  52.35 
 
 
556 aa  532  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  52.25 
 
 
558 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  42.68 
 
 
559 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  42.05 
 
 
550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  38.29 
 
 
620 aa  200  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.22 
 
 
622 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.38 
 
 
536 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.53 
 
 
551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.38 
 
 
611 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.07 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.81 
 
 
577 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  23.33 
 
 
543 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.56 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  23.36 
 
 
545 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  23.58 
 
 
545 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  29.96 
 
 
961 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  25.61 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  25.43 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  23.12 
 
 
528 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  22.4 
 
 
467 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  22.45 
 
 
446 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  28.76 
 
 
413 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  23.88 
 
 
416 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.78 
 
 
472 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  27.49 
 
 
492 aa  60.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  26.72 
 
 
472 aa  60.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  23.96 
 
 
422 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.8 
 
 
430 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  21.68 
 
 
545 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  25.41 
 
 
486 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  25.77 
 
 
484 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  27.89 
 
 
474 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  23.14 
 
 
486 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.44 
 
 
478 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  25.42 
 
 
410 aa  58.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  28.12 
 
 
537 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.3 
 
 
478 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  24.17 
 
 
487 aa  57.4  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.45 
 
 
484 aa  57  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  22.51 
 
 
585 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  23.91 
 
 
299 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  24.25 
 
 
486 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  25.19 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  27.98 
 
 
491 aa  55.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.25 
 
 
386 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  25.26 
 
 
486 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  24.65 
 
 
484 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  25.26 
 
 
486 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  22.87 
 
 
486 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.53 
 
 
459 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  29.1 
 
 
393 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  25.59 
 
 
467 aa  55.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  27.59 
 
 
396 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  24.86 
 
 
486 aa  54.3  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  25.59 
 
 
467 aa  53.9  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  27.99 
 
 
478 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  25.5 
 
 
486 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  26.45 
 
 
355 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  25.5 
 
 
486 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  25.5 
 
 
486 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  24.6 
 
 
484 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  25.5 
 
 
486 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2987  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  20.81 
 
 
349 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  25.3 
 
 
486 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  25.5 
 
 
486 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  23.16 
 
 
484 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  23.51 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  24.38 
 
 
404 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  25.07 
 
 
413 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  24.1 
 
 
476 aa  51.2  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  25.07 
 
 
413 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  25.07 
 
 
413 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  27.01 
 
 
203 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  25.07 
 
 
413 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  25.07 
 
 
413 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.54 
 
 
487 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  28.22 
 
 
180 aa  50.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  25.93 
 
 
529 aa  50.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  26.85 
 
 
169 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  24.75 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.63 
 
 
481 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  24.93 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.93 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  28.19 
 
 
183 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  24.36 
 
 
299 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  24.93 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  24.36 
 
 
299 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  42.31 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.63 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  24.93 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  24.93 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  24.93 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  24.38 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  24.93 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  24.93 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  24.93 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  29.03 
 
 
183 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.49 
 
 
349 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  22.89 
 
 
401 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>