71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3474 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 577 aa  1193    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.75 
 
 		 534 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  28.6 
 
 		 531 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  29.16 
 
 		 961 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  26.23 
 
 		 556 aa  101  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 		 558 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  25.26 
 
 		 550 aa  86.3  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  26.3 
 
 		 620 aa  86.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.08 
 
 		 622 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  23.49 
 
 		 559 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.81 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.14 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.57 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.03 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.54 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.49 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.26 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  27.61 
 
 		 184 aa  55.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  28.03 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  26.61 
 
 		 492 aa  52  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  23.03 
 
 		 203 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  31.21 
 
 		 439 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.09 
 
 		 196 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.22 
 
 		 611 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.89 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  27.15 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  25.13 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  27.69 
 
 		 420 aa  48.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  26.06 
 
 		 397 aa  47.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3516  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.65 
 
 		 417 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3452  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.65 
 
 		 417 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3435  phospholipase D/transphosphatidylase  30.14 
 
 		 420 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  27.07 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  38.89 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  26.12 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  24.85 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.14 
 
 		 476 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.36 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  26.67 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0427  phospholipase D/transphosphatidylase  23.78 
 
 		 190 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31941  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.92 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0101  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.35 
 
 		 683 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0642638  normal  0.0241528 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  34.62 
 
 		 440 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  25.47 
 
 		 176 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  26.28 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  26.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  26.28 
 
 		 406 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3316  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  26.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  26.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  30.95 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  26.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  26.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  26.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  30.95 
 
 		 481 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.99 
 
 		 564 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  26 
 
 		 223 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  30.57 
 
 		 486 aa  44.3  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2831  hypothetical protein  28.17 
 
 		 180 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000246961  decreased coverage  0.0000127532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  30.57 
 
 		 486 aa  44.3  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.99 
 
 		 564 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.38 
 
 		 477 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  27.69 
 
 		 196 aa  44.3  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  23.12 
 
 		 481 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  27.54 
 
 		 477 aa  43.9  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  28.44 
 
 		 476 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  23.08 
 
 		 406 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  26.06 
 
 		 478 aa  43.9  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  25.56 
 
 		 176 aa  43.9  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  25.56 
 
 		 176 aa  43.9  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  27.54 
 
 		 758 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>