30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0308 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
611 aa  1236    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  28.08 
 
 
559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  26.04 
 
 
556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  27.06 
 
 
550 aa  146  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.24 
 
 
560 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  22.9 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  24.35 
 
 
620 aa  118  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.54 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.08 
 
 
586 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.1 
 
 
622 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.75 
 
 
551 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.23 
 
 
349 aa  77  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  23 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0305  phospholipase D/transphosphatidylase  23.51 
 
 
353 aa  66.6  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  22.33 
 
 
355 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  22.96 
 
 
297 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  21.71 
 
 
299 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  21.71 
 
 
299 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  22.52 
 
 
299 aa  55.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.04 
 
 
430 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  26.97 
 
 
300 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.22 
 
 
577 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  28.15 
 
 
558 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  39.62 
 
 
440 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  42.11 
 
 
531 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  26.92 
 
 
539 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  25.93 
 
 
553 aa  47.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  27.41 
 
 
558 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  22.64 
 
 
542 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0163  hypothetical protein  25.32 
 
 
287 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>