114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1868 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
300 aa  603  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  27.11 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  27.11 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  26.24 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  35.48 
 
 
196 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  33.57 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  27.54 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.67 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  28.5 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.79 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.76 
 
 
545 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  28.86 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  26.2 
 
 
404 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.76 
 
 
545 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  20.77 
 
 
467 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  21.71 
 
 
472 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  23.08 
 
 
545 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  30.83 
 
 
175 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  19.39 
 
 
479 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  27.13 
 
 
169 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  21.01 
 
 
416 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  27.13 
 
 
183 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  23.15 
 
 
392 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  30.41 
 
 
176 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.17 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  26.92 
 
 
184 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  33.09 
 
 
177 aa  53.9  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  26.85 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.67 
 
 
386 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.09 
 
 
551 aa  53.1  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  25.49 
 
 
186 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  21.19 
 
 
528 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  21.15 
 
 
446 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  22.86 
 
 
358 aa  52  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  26.83 
 
 
176 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  22.18 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  21.93 
 
 
439 aa  51.2  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1335  phospholipase D/transphosphatidylase  38.33 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  28.15 
 
 
162 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.28 
 
 
196 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  27.34 
 
 
193 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  21.93 
 
 
260 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.3 
 
 
207 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.37 
 
 
536 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.3 
 
 
242 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  23.48 
 
 
184 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  23.15 
 
 
448 aa  49.3  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.97 
 
 
611 aa  49.3  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.24 
 
 
493 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.3 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  42.31 
 
 
548 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  23.14 
 
 
556 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  24.26 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  21.22 
 
 
585 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  38.24 
 
 
473 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  33.62 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  32.5 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3068  phospholipase D/transphosphatidylase  20.59 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  33.62 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  33.62 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  33.62 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  33.62 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  33.62 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  38.24 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  38.24 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  38.24 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  38.24 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  31.3 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  38.24 
 
 
473 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  38.24 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  38.24 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.62 
 
 
484 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  27.74 
 
 
197 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  31.3 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.08 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  20.53 
 
 
543 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  32.76 
 
 
223 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  31.3 
 
 
242 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  32.79 
 
 
176 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  32.79 
 
 
176 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  38.1 
 
 
495 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.33 
 
 
492 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  26.85 
 
 
205 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3852  phospholipase D/transphosphatidylase  24.7 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.0109744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2543  phospholipase D/Transphosphatidylase  19.34 
 
 
567 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.43955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  27.91 
 
 
180 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  26.09 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  28.18 
 
 
558 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  31.58 
 
 
576 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  22.54 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  25.71 
 
 
483 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  30.25 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0412  phospholipase D/transphosphatidylase  32.69 
 
 
560 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127464  hitchhiker  0.00000145574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.93 
 
 
193 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  25.71 
 
 
483 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  25.9 
 
 
190 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  35.29 
 
 
434 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  35.29 
 
 
434 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  35.29 
 
 
434 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  35.29 
 
 
434 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>