40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3852 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3852  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.0109744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2205  phospholipase D/transphosphatidylase  41.25 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2730  endonuclease  33.87 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.966957  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2519  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  33.33 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0468  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  31.89 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1275  hypothetical protein  30.56 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0228  phospholipase D/transphosphatidylase  27.57 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1335  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  31.33 
 
 		 416 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  25.64 
 
 		 477 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  25.64 
 
 		 477 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  26.04 
 
 		 489 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  30.72 
 
 		 446 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3757  hypothetical protein  27.1 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  28.97 
 
 		 481 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  23.6 
 
 		 518 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 		 180 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  42 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  24.7 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  24.66 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  28 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  27.13 
 
 		 479 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.27 
 
 		 430 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  21.83 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  25.9 
 
 		 479 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  26.11 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  26.11 
 
 		 490 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  27.33 
 
 		 472 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  31.51 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  25.53 
 
 		 479 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  25.18 
 
 		 481 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  25.18 
 
 		 479 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4882  hypothetical protein  28.14 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  25.9 
 
 		 479 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  23.24 
 
 		 481 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  22.79 
 
 		 400 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  22.86 
 
 		 400 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  21.38 
 
 		 490 aa  42.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  25.17 
 
 		 400 aa  42  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  23.23 
 
 		 502 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>