16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0468 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0468  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  100 
 
 
247 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2519  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  57.56 
 
 
251 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2730  endonuclease  54.32 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.966957  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2205  phospholipase D/transphosphatidylase  28.8 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460983  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3852  phospholipase D/transphosphatidylase  31.89 
 
 
263 aa  92.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.0109744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1275  hypothetical protein  29.84 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0228  phospholipase D/transphosphatidylase  23.56 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.15 
 
 
478 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.7 
 
 
420 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  30.4 
 
 
234 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  26.8 
 
 
478 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0815  hypothetical protein  29.7 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.740919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0831  hypothetical protein  29.7 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1335  phospholipase D/transphosphatidylase  23.57 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  21.48 
 
 
401 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.17 
 
 
481 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>