60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2205 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2205  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3852  phospholipase D/transphosphatidylase  41.25 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.0109744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0468  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.8 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2730  endonuclease  35.54 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.966957  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2519  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  31.48 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1275  hypothetical protein  25.66 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1335  phospholipase D/transphosphatidylase  28.87 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  26.7 
 
 		 475 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  26.81 
 
 		 400 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0228  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122659 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.41 
 
 		 551 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  28.48 
 
 		 446 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3757  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.51 
 
 		 478 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.36 
 
 		 484 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0815  hypothetical protein  28.85 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.740919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0831  hypothetical protein  28.85 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  24.32 
 
 		 470 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  24.24 
 
 		 476 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  25.18 
 
 		 422 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  23.78 
 
 		 476 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  25.66 
 
 		 397 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 478 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.66 
 
 		 397 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.66 
 
 		 397 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.66 
 
 		 397 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.95 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  27.13 
 
 		 478 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  25.64 
 
 		 490 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.91 
 
 		 397 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  22.38 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.14 
 
 		 482 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  27.22 
 
 		 416 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  24.55 
 
 		 484 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  28.12 
 
 		 397 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  27.05 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  20.81 
 
 		 490 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  26.56 
 
 		 397 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  29.36 
 
 		 467 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  23.33 
 
 		 481 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  24.4 
 
 		 468 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  26.62 
 
 		 479 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  25 
 
 		 478 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  22.9 
 
 		 476 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  24.44 
 
 		 416 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  24.44 
 
 		 487 aa  42.7  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  27.12 
 
 		 483 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  27.42 
 
 		 422 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  23.36 
 
 		 476 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.9 
 
 		 476 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  26.62 
 
 		 479 aa  42.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  27.12 
 
 		 483 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  20.97 
 
 		 481 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  23.36 
 
 		 476 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  28.04 
 
 		 537 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  26.27 
 
 		 479 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  27.42 
 
 		 477 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.82 
 
 		 374 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  24.16 
 
 		 400 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>