269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1024 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  100 
 
 		 422 aa  859    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  86.06 
 
 		 413 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  62.72 
 
 		 416 aa  521  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  57.21 
 
 		 446 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  24.34 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  23.75 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  23.75 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  27.89 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.57 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  30.07 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.4 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  26.63 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.56 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  27.32 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.93 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.49 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  25.38 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.63 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  26.65 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  25.78 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  26.23 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  25.93 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.7 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.7 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  25.81 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  23.24 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.9 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  27.14 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.76 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.39 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.68 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  25.66 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  25.77 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  25.46 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  24.1 
 
 		 474 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.28 
 
 		 485 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.21 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  25.66 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  26.71 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  27.35 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.77 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  27.74 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  27.56 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  26.96 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  25.15 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.17 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  25.51 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.38 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  28.75 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.84 
 
 		 586 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  28.75 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  25.81 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  28.75 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  28.75 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  28.75 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  24.27 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  23.14 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  28.97 
 
 		 558 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  24.51 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  23.17 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.66 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.37 
 
 		 374 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  31.34 
 
 		 516 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  31.34 
 
 		 516 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  24.78 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  23.05 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  31.34 
 
 		 560 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.14 
 
 		 483 aa  53.5  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2883  cardiolipin synthetase  24.86 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.2 
 
 		 484 aa  53.1  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  26.2 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  26.92 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  26.1 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  25.6 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  24.23 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  26.13 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  25.42 
 
 		 184 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  26.1 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0889  phospholipase D/transphosphatidylase  24.86 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  26.1 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  24 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.99 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  28.07 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.99 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  22.87 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  24.26 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0429  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.81 
 
 		 530 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.28 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  30.53 
 
 		 570 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  31.58 
 
 		 516 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  25.97 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  27.15 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  23.9 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.03 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  23.9 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  41.18 
 
 		 516 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.97 
 
 		 536 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  41.18 
 
 		 516 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.2 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  30.32 
 
 		 516 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>