More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0791 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  100 
 
 
570 aa  1163    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  58.65 
 
 
543 aa  677    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0797  phospholipase D/transphosphatidylase  94.39 
 
 
566 aa  1051    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  41.45 
 
 
535 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  40.97 
 
 
505 aa  360  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  42.05 
 
 
515 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  38.89 
 
 
495 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  39.96 
 
 
540 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  40.16 
 
 
540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.53 
 
 
514 aa  334  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.15 
 
 
493 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  38.37 
 
 
538 aa  333  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  40.18 
 
 
434 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  40.18 
 
 
434 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  40.18 
 
 
434 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  40.18 
 
 
434 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  40.18 
 
 
434 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  38.41 
 
 
473 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  38.41 
 
 
473 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  38.41 
 
 
476 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  38.41 
 
 
476 aa  330  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  38.41 
 
 
476 aa  330  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  38.2 
 
 
473 aa  330  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  38.41 
 
 
476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  38.59 
 
 
514 aa  329  8e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  38 
 
 
473 aa  329  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  37.02 
 
 
516 aa  329  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  37.4 
 
 
543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  37.88 
 
 
508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  36.65 
 
 
522 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  34.88 
 
 
548 aa  318  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  39.63 
 
 
517 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  38.63 
 
 
517 aa  317  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  37.73 
 
 
544 aa  316  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  38.07 
 
 
532 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.35 
 
 
517 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  36.57 
 
 
560 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  36.57 
 
 
516 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  36.57 
 
 
516 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  36.16 
 
 
516 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  36.74 
 
 
516 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  37.11 
 
 
514 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  36.85 
 
 
507 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  33.6 
 
 
534 aa  283  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  35.24 
 
 
505 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.94 
 
 
529 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.57 
 
 
564 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.57 
 
 
564 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  34.6 
 
 
517 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  34.46 
 
 
529 aa  262  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.35 
 
 
519 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
557 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  33.55 
 
 
515 aa  257  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.23 
 
 
520 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  33.75 
 
 
529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  35.8 
 
 
562 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  34.11 
 
 
522 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  33.2 
 
 
541 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  33.2 
 
 
540 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  33.2 
 
 
540 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  33.2 
 
 
540 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  32.66 
 
 
549 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  32.85 
 
 
516 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  33.12 
 
 
516 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  33.12 
 
 
516 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  31.87 
 
 
558 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  32.8 
 
 
540 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  32.8 
 
 
540 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  32.59 
 
 
517 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6085  putative lipoprotein  33.12 
 
 
517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  32.56 
 
 
517 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  33.93 
 
 
553 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  32.18 
 
 
517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3384  cardiolipin synthetase, putative  33.49 
 
 
525 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  31.96 
 
 
518 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  32.91 
 
 
522 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.29 
 
 
524 aa  233  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.76 
 
 
551 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  33.26 
 
 
520 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  33.62 
 
 
542 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 
519 aa  231  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  33.18 
 
 
550 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  33.18 
 
 
550 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  33.18 
 
 
550 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  33.18 
 
 
595 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  31.73 
 
 
502 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0603365 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  33.18 
 
 
550 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  33.18 
 
 
550 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  34.04 
 
 
526 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  32.95 
 
 
550 aa  227  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.52 
 
 
534 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5202  phospholipase D/transphosphatidylase  36.59 
 
 
602 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.440648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  30.5 
 
 
510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  27.84 
 
 
575 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  32.7 
 
 
510 aa  216  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1121  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.16 
 
 
535 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  30.04 
 
 
506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  27.32 
 
 
576 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.34 
 
 
527 aa  200  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2543  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.27 
 
 
567 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.43955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>