More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1811 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  62.55 
 
 		 538 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 532 aa  1087    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  51.32 
 
 		 534 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5202  phospholipase D/transphosphatidylase  49.21 
 
 		 602 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.440648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  44 
 
 		 517 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  45.86 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  45.86 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  45.86 
 
 		 560 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  43.55 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  44.36 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  44.03 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  44.64 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  41.32 
 
 		 535 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  45.62 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  43.62 
 
 		 558 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  41.8 
 
 		 540 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  41.14 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  43.02 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  44.09 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.64 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  41.41 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  40.82 
 
 		 544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  39.54 
 
 		 507 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  41.26 
 
 		 562 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  41.61 
 
 		 553 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  38.65 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  38.73 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  41.65 
 
 		 514 aa  349  9e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  36.45 
 
 		 515 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  40.86 
 
 		 549 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  40.89 
 
 		 495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  37.6 
 
 		 522 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  40.53 
 
 		 540 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  41.82 
 
 		 543 aa  340  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  40.71 
 
 		 540 aa  339  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  41.23 
 
 		 541 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  40.96 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  40.26 
 
 		 540 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  40.26 
 
 		 540 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  41.37 
 
 		 550 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  41.37 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  41.37 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  41.37 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  41.37 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  41.67 
 
 		 595 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  40.07 
 
 		 540 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  38.28 
 
 		 514 aa  332  8e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  40.99 
 
 		 550 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  41.92 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  41.72 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  41.72 
 
 		 476 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  41.72 
 
 		 473 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.77 
 
 		 493 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  41.72 
 
 		 473 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  41.72 
 
 		 476 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  41.72 
 
 		 476 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  41.51 
 
 		 473 aa  329  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.7 
 
 		 514 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  40.58 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  38.91 
 
 		 529 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0797  phospholipase D/transphosphatidylase  37.88 
 
 		 566 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  41.52 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  41.52 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  41.52 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  41.52 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  41.52 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  38.07 
 
 		 570 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  36.61 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.6 
 
 		 529 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  38.57 
 
 		 520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  39.27 
 
 		 517 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6085  putative lipoprotein  40.45 
 
 		 517 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.04 
 
 		 564 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.04 
 
 		 564 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.04 
 
 		 551 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  38.48 
 
 		 519 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.49 
 
 		 527 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.37 
 
 		 534 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  37.03 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.81 
 
 		 520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  37.8 
 
 		 516 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  37.77 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  37.77 
 
 		 516 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  37.29 
 
 		 522 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  33.46 
 
 		 510 aa  282  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  37.3 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  37.3 
 
 		 517 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  37.23 
 
 		 517 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  36.55 
 
 		 542 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  34.98 
 
 		 575 aa  278  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.18 
 
 		 519 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  36.72 
 
 		 526 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.82 
 
 		 524 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1121  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.45 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  31.65 
 
 		 510 aa  266  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5200  phospholipase D/transphosphatidylase  33.74 
 
 		 604 aa  263  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2543  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.63 
 
 		 567 aa  263  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.43955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4772  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.39 
 
 		 583 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  32.97 
 
 		 576 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0412  phospholipase D/transphosphatidylase  35.48 
 
 		 560 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127464  hitchhiker  0.00000145574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>