More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1456 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 522 aa  1073    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  59.8 
 
 		 507 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  55.12 
 
 		 514 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  50.87 
 
 		 540 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  51.06 
 
 		 540 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  51.76 
 
 		 544 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  51.01 
 
 		 508 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  44.51 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.86 
 
 		 517 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  43.7 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  43.17 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  41.78 
 
 		 560 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  41.78 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  41.78 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  41.14 
 
 		 538 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  41.36 
 
 		 495 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  41.83 
 
 		 516 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  42.3 
 
 		 535 aa  361  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  38.65 
 
 		 532 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  38.65 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  41.95 
 
 		 505 aa  346  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  40.43 
 
 		 516 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  39.27 
 
 		 534 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.92 
 
 		 493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  41.92 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  41.92 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  41.92 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  41.92 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  41.92 
 
 		 476 aa  340  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  41.92 
 
 		 473 aa  339  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  41.92 
 
 		 476 aa  339  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  39.42 
 
 		 548 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  41.89 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  41.92 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  37.73 
 
 		 543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  39.67 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.3 
 
 		 529 aa  333  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.02 
 
 		 514 aa  333  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  40.88 
 
 		 514 aa  332  8e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  39.06 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  40.98 
 
 		 515 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.92 
 
 		 557 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  40.23 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  40.23 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  40.23 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  40.23 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  40.23 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0797  phospholipase D/transphosphatidylase  38.38 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  39.48 
 
 		 570 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  38.36 
 
 		 549 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  37.84 
 
 		 541 aa  317  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  38.51 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  40.48 
 
 		 520 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  37.41 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  37.11 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  37.59 
 
 		 540 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  37.29 
 
 		 522 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  36.95 
 
 		 540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  36.95 
 
 		 540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  36.52 
 
 		 516 aa  307  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  36.76 
 
 		 540 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  36.72 
 
 		 558 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  38.21 
 
 		 542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  36.24 
 
 		 522 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  37.9 
 
 		 595 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  37.9 
 
 		 550 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  37.9 
 
 		 550 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  37.9 
 
 		 550 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  37.9 
 
 		 550 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  37.9 
 
 		 550 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  37.7 
 
 		 517 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  37.43 
 
 		 526 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  37.71 
 
 		 550 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  37.62 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  37.38 
 
 		 517 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  36.94 
 
 		 562 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.35 
 
 		 520 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  37.97 
 
 		 519 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  38.1 
 
 		 518 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6085  putative lipoprotein  37.79 
 
 		 517 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5202  phospholipase D/transphosphatidylase  44.53 
 
 		 602 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.440648  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.72 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  36.9 
 
 		 516 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  36.97 
 
 		 516 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.52 
 
 		 564 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.52 
 
 		 564 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  36.13 
 
 		 516 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  34.3 
 
 		 510 aa  282  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  34.52 
 
 		 510 aa  277  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  33.82 
 
 		 575 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.83 
 
 		 534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.68 
 
 		 524 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.38 
 
 		 527 aa  274  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  33.46 
 
 		 506 aa  273  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.13 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  33.79 
 
 		 518 aa  263  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1121  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.29 
 
 		 535 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5200  phospholipase D/transphosphatidylase  31.63 
 
 		 604 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.7 
 
 		 502 aa  249  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0603365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0412  phospholipase D/transphosphatidylase  32.68 
 
 		 560 aa  243  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127464  hitchhiker  0.00000145574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>