More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5202 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5202  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
602 aa  1220    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.440648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  55.48 
 
 
534 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  53.56 
 
 
538 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  49.14 
 
 
532 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.29 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  40.64 
 
 
517 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  39.82 
 
 
560 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  39.82 
 
 
516 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  39.82 
 
 
516 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  39.01 
 
 
516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  36.94 
 
 
540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  39.12 
 
 
516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  36.77 
 
 
540 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  37.33 
 
 
508 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  38.91 
 
 
535 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  40.38 
 
 
515 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  42.24 
 
 
543 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  39.58 
 
 
548 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  36.06 
 
 
544 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  47.45 
 
 
517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  38.55 
 
 
553 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  35.84 
 
 
514 aa  312  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  37.55 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  47.47 
 
 
505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.64 
 
 
493 aa  308  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  37.36 
 
 
476 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  35.71 
 
 
522 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  37.36 
 
 
476 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  37.36 
 
 
476 aa  306  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  37.34 
 
 
473 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  37.34 
 
 
473 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  37.15 
 
 
473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  37.15 
 
 
473 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  35.93 
 
 
558 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.1 
 
 
557 aa  299  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  36.36 
 
 
495 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.88 
 
 
551 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  41.07 
 
 
507 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  35.4 
 
 
529 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  32.57 
 
 
522 aa  283  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  41.02 
 
 
514 aa  280  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  34.7 
 
 
541 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.44 
 
 
514 aa  274  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  35.08 
 
 
522 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  33.69 
 
 
516 aa  273  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  42.86 
 
 
562 aa  272  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  42.39 
 
 
529 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.82 
 
 
529 aa  270  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  34.2 
 
 
542 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  35.23 
 
 
520 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  43.18 
 
 
549 aa  270  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  34.69 
 
 
526 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  34.18 
 
 
517 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  36.39 
 
 
515 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  36.62 
 
 
434 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  36.62 
 
 
434 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  36.62 
 
 
434 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  36.62 
 
 
434 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  36.62 
 
 
434 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  42.07 
 
 
540 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  42.07 
 
 
540 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  42.07 
 
 
540 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  34.12 
 
 
518 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  41.53 
 
 
540 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  41.29 
 
 
540 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  34.01 
 
 
517 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  44.24 
 
 
550 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  44.24 
 
 
550 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  44.24 
 
 
550 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  44.24 
 
 
550 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  44.24 
 
 
550 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  33.51 
 
 
517 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  44.24 
 
 
595 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.66 
 
 
519 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  43.72 
 
 
550 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.57 
 
 
520 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  40.66 
 
 
516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  39.4 
 
 
517 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  40.66 
 
 
516 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  40.54 
 
 
516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.45 
 
 
534 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 
519 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  35.9 
 
 
505 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.18 
 
 
524 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  39.18 
 
 
543 aa  248  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6085  putative lipoprotein  39.42 
 
 
517 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.17 
 
 
564 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.17 
 
 
564 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1121  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.5 
 
 
535 aa  240  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  35.32 
 
 
576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 
518 aa  233  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  36.59 
 
 
570 aa  232  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0797  phospholipase D/transphosphatidylase  35.88 
 
 
566 aa  231  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2543  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.84 
 
 
567 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.43955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  35.37 
 
 
510 aa  227  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  36.5 
 
 
510 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.58 
 
 
527 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  34.05 
 
 
575 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0412  phospholipase D/transphosphatidylase  34.23 
 
 
560 aa  208  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127464  hitchhiker  0.00000145574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  32.3 
 
 
506 aa  200  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>