81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0495 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
556 aa  1143    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  56.17 
 
 
558 aa  625  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.8 
 
 
560 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  43.3 
 
 
559 aa  435  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  41.73 
 
 
550 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  37.94 
 
 
620 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 
622 aa  191  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.49 
 
 
536 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.69 
 
 
551 aa  189  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.04 
 
 
611 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.47 
 
 
586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.33 
 
 
577 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.61 
 
 
534 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  24.61 
 
 
543 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  24.68 
 
 
531 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  25.94 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.51 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  23.39 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  22.43 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  30.07 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  23.41 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  30.07 
 
 
422 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25.07 
 
 
585 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  29.06 
 
 
440 aa  61.2  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.21 
 
 
349 aa  60.5  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.91 
 
 
430 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  22.97 
 
 
416 aa  57.4  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  25.52 
 
 
479 aa  57.4  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  29.82 
 
 
196 aa  57  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  21.83 
 
 
545 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  23.53 
 
 
528 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  21.04 
 
 
545 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  21.04 
 
 
545 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  23.12 
 
 
297 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.86 
 
 
484 aa  53.9  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  34.82 
 
 
180 aa  53.5  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  31.87 
 
 
194 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  32.08 
 
 
189 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.03 
 
 
207 aa  51.6  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.22 
 
 
207 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.22 
 
 
242 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  26.77 
 
 
518 aa  51.2  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  26.71 
 
 
169 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  31.58 
 
 
203 aa  50.4  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.22 
 
 
207 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  28.29 
 
 
242 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.29 
 
 
207 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.22 
 
 
245 aa  50.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  21.64 
 
 
355 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  25 
 
 
183 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  26.71 
 
 
183 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  30.51 
 
 
234 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  28.1 
 
 
223 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.8 
 
 
363 aa  47.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  29.09 
 
 
190 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  22.92 
 
 
356 aa  47  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  26 
 
 
175 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.19 
 
 
196 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  27.95 
 
 
516 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.81 
 
 
366 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  20.48 
 
 
358 aa  45.1  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  33.02 
 
 
180 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  28.1 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  28.1 
 
 
223 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  31.15 
 
 
961 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  28.1 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  28.1 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  28.1 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  28.1 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  28.1 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  31.53 
 
 
184 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  21.23 
 
 
394 aa  45.1  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  23.18 
 
 
299 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  25 
 
 
505 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.97 
 
 
479 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  30.87 
 
 
427 aa  44.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1011  hypothetical protein  27.85 
 
 
496 aa  44.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  24 
 
 
472 aa  44.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  25.63 
 
 
467 aa  44.3  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  24.49 
 
 
412 aa  44.3  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  21.77 
 
 
413 aa  43.5  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>