35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1011 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1011  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1013    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000048578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  25.32 
 
 		 422 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  26.73 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  27.14 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  30.45 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  30.65 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  32.84 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  25.23 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  24.5 
 
 		 413 aa  47  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  23.83 
 
 		 413 aa  47  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  26.59 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  25 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.72 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  24.02 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  23.83 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  23.83 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  23.83 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  23.83 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  26.58 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  23.83 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  28.09 
 
 		 556 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  23.83 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  26.65 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  23.29 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  29.88 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0455  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.42 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.22 
 
 		 219 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  23.49 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0278  phospholipase D family protein  26.42 
 
 		 366 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 396 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.09 
 
 		 395 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.16 
 
 		 529 aa  43.5  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46400  predicted protein  23.27 
 
 		 567 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>