115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1319 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  52.7 
 
 
193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  36.57 
 
 
206 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.81 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  25.99 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  28.8 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  33.07 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  28.67 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.21 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  32.46 
 
 
448 aa  63.9  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.31 
 
 
363 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  27.32 
 
 
186 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  28.77 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.17 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.87 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.07 
 
 
386 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  31.48 
 
 
311 aa  60.1  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  26.54 
 
 
176 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  26.54 
 
 
176 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  26.26 
 
 
183 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  25.97 
 
 
404 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 
393 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 
376 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  28.99 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  26.63 
 
 
180 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  24.87 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  28.85 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  22.4 
 
 
545 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2831  hypothetical protein  30.22 
 
 
180 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000246961  decreased coverage  0.0000127532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  27.63 
 
 
176 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  27.46 
 
 
389 aa  55.1  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  28.26 
 
 
286 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  26.32 
 
 
230 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  28.57 
 
 
392 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.17 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.54 
 
 
472 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.17 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.17 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  26.19 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  27.03 
 
 
543 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  26.19 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  26.53 
 
 
479 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.17 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.17 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  24.18 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.17 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  21.88 
 
 
545 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  27.1 
 
 
487 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.57 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  27.37 
 
 
467 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  27.81 
 
 
481 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25.95 
 
 
585 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  28.37 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  27.66 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  25.9 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.11 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  25.18 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  28.37 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  24.65 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  28.37 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  28.37 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.86 
 
 
349 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  28.37 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  28.37 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  28.37 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.34 
 
 
484 aa  48.9  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  27.7 
 
 
355 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  29.41 
 
 
358 aa  48.5  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  26.32 
 
 
260 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  27.78 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  26.32 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  25.71 
 
 
234 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  23.78 
 
 
528 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  26.67 
 
 
299 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  25.55 
 
 
151 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  24.66 
 
 
184 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  25 
 
 
359 aa  46.2  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.89 
 
 
483 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.03 
 
 
430 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  30.95 
 
 
394 aa  45.8  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.85 
 
 
366 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 
582 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  28.48 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  25 
 
 
188 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  25.6 
 
 
758 aa  45.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  24 
 
 
176 aa  45.1  0.0009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.37 
 
 
392 aa  45.1  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  28.05 
 
 
502 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1011  hypothetical protein  27.22 
 
 
496 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  23.93 
 
 
478 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  25.97 
 
 
620 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  22.06 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  27.39 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  25.74 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.23 
 
 
464 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  31.01 
 
 
422 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  28.1 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2123  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.66 
 
 
394 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  21.99 
 
 
545 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.23 
 
 
464 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>