138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0279 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  97.55 
 
 		 286 aa  548  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  35.99 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  32.42 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  27.46 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.27 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  25.77 
 
 		 467 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  26.42 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  32.28 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  27.74 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  27.27 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  31.58 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  28.35 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  29.5 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.02 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  30.99 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  25.97 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  22.83 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  23.77 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.8 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  24.62 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  22.64 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  23.02 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  28.5 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  28.15 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  25.46 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.07 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  23.36 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  28.08 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  30.53 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  27.41 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  23.68 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  23.98 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  22.48 
 
 		 545 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  28.06 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  29.32 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  23.17 
 
 		 543 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  22.48 
 
 		 545 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  26.53 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  28.89 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.26 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  27.74 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  26.17 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.5 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  26.17 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  26.17 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  26.17 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  26.17 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  26.17 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  28.57 
 
 		 194 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  26.84 
 
 		 358 aa  53.1  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  26.17 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  28.1 
 
 		 479 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  26.17 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  28.99 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  30.51 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  24.83 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  28.68 
 
 		 479 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.13 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  28.68 
 
 		 479 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  22.38 
 
 		 591 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.99 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  28.68 
 
 		 479 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  23.88 
 
 		 467 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  23.88 
 
 		 467 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  24.84 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.47 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  22.44 
 
 		 169 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.05 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  24.05 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  26.83 
 
 		 184 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  28.1 
 
 		 479 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  28.1 
 
 		 479 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  28.1 
 
 		 479 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.36 
 
 		 483 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.53 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  23.93 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.32 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  24.03 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  24.32 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.63 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  24.32 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  26.57 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  25.55 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0429  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.01 
 
 		 530 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  24.16 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  25.36 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 417 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.38 
 
 		 590 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.82 
 
 		 478 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  28.1 
 
 		 758 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  22.62 
 
 		 484 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  22.88 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  22.88 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  19.91 
 
 		 484 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  25.11 
 
 		 486 aa  46.2  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  24.11 
 
 		 484 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>