149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2452 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  85.48 
 
 		 194 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  87.04 
 
 		 189 aa  286  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  48.77 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  43.33 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  43.75 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  43.75 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  37.25 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  33.77 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  40.29 
 
 		 234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.06 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.22 
 
 		 245 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.18 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.54 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  36.54 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  32.5 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  37.58 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  37.58 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  38.51 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  36.54 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  37.67 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  37.67 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  31.69 
 
 		 177 aa  94.7  7e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  39.19 
 
 		 223 aa  94.4  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  39.19 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  39.19 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  39.19 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  39.19 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  39.19 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  39.19 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  38.51 
 
 		 223 aa  92  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  32.92 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  32.03 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  36.99 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  32.03 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  36.14 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  28.11 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  34.62 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  35.29 
 
 		 758 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  35.21 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.71 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  35.66 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.52 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  33.57 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.41 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  27.97 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  29.94 
 
 		 404 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.41 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.72 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  29.61 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  31.21 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  31.64 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.52 
 
 		 363 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  25.68 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  27.87 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  28.69 
 
 		 230 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.74 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.71 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  54.9 
 
 		 575 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  32.54 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  39.71 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.88 
 
 		 484 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  31.98 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  31.58 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  31.58 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  51.02 
 
 		 715 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  26.47 
 
 		 286 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  45.83 
 
 		 548 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  40.3 
 
 		 569 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3119  hypothetical protein  28.06 
 
 		 383 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274638  hitchhiker  0.00609959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  30.83 
 
 		 393 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 286 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  24.46 
 
 		 410 aa  49.3  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  30.81 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.11 
 
 		 386 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  30.23 
 
 		 403 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  26.72 
 
 		 294 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  28.36 
 
 		 439 aa  48.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  24.2 
 
 		 561 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  30.68 
 
 		 405 aa  48.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.54 
 
 		 384 aa  47.8  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.77 
 
 		 560 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  51.02 
 
 		 659 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  27.86 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  23.93 
 
 		 545 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  23.93 
 
 		 545 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  24.88 
 
 		 397 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  34.92 
 
 		 424 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.22 
 
 		 349 aa  45.1  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  24.41 
 
 		 397 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.63 
 
 		 536 aa  45.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.12 
 
 		 397 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2543  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.74 
 
 		 567 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.43955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 462 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  34.92 
 
 		 424 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  34.92 
 
 		 424 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.92 
 
 		 397 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>