209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5578 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
234 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  47.22 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  47.22 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  43.45 
 
 
176 aa  139  3e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.83 
 
 
198 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  47.41 
 
 
203 aa  130  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  45.64 
 
 
176 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  45.64 
 
 
176 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  45.26 
 
 
175 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  41.25 
 
 
197 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  41.01 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  39.19 
 
 
189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  40.29 
 
 
189 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  39.6 
 
 
184 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  40.54 
 
 
184 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  40.28 
 
 
169 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  40.28 
 
 
183 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  37.41 
 
 
177 aa  104  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  35.54 
 
 
223 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  35.54 
 
 
207 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  35.54 
 
 
207 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  35.54 
 
 
207 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  35.54 
 
 
207 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  35.54 
 
 
207 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  35.54 
 
 
207 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  37.41 
 
 
190 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  38.19 
 
 
176 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  36.55 
 
 
242 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  36.81 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  36.55 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.55 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.55 
 
 
207 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  36.55 
 
 
207 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  37.41 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  37.93 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  33.13 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  34.46 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  36.67 
 
 
758 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
196 aa  91.7  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  38.03 
 
 
186 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  33.56 
 
 
193 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  32.41 
 
 
183 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.12 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 
404 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.81 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  34.39 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  37.4 
 
 
393 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  35.34 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  27.14 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  32.52 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  31.25 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  32.34 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  31.25 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.04 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.62 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  33.33 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.57 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.47 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.73 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  32.91 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.48 
 
 
484 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  34.31 
 
 
487 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  35.48 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  37.14 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  37.14 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  37.14 
 
 
161 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  37.14 
 
 
161 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  37.14 
 
 
181 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  37.14 
 
 
161 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  32.06 
 
 
180 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  32.35 
 
 
481 aa  58.5  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  24.75 
 
 
545 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.59 
 
 
366 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  24.75 
 
 
545 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  26.41 
 
 
458 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.2 
 
 
349 aa  55.5  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5710  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.73 
 
 
391 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  29.23 
 
 
487 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  32.82 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  23.48 
 
 
359 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  32.14 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  29.51 
 
 
206 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  31.58 
 
 
477 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.55 
 
 
472 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.24 
 
 
474 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.08 
 
 
536 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.6 
 
 
445 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  30.91 
 
 
486 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 
424 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  22.54 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  28 
 
 
478 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 
424 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  26.09 
 
 
355 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1154  hypothetical protein  32.58 
 
 
173 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  26.15 
 
 
484 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  26.32 
 
 
476 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  22.82 
 
 
472 aa  48.9  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.66 
 
 
486 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>