184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3593 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
393 aa  809    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  71.85 
 
 
376 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.12 
 
 
386 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  46.44 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.9 
 
 
363 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  34.87 
 
 
392 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  42.86 
 
 
184 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.36 
 
 
472 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  25.34 
 
 
467 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  24.94 
 
 
528 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  39.86 
 
 
213 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.87 
 
 
545 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  28.29 
 
 
481 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  39.86 
 
 
213 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  28.21 
 
 
487 aa  97.4  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  26.34 
 
 
479 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  38.97 
 
 
203 aa  97.1  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.6 
 
 
545 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  24.72 
 
 
545 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  23.7 
 
 
543 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  36.5 
 
 
193 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  35.29 
 
 
176 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  35.67 
 
 
176 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  35.67 
 
 
176 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.56 
 
 
198 aa  90.1  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  37.4 
 
 
234 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  34.62 
 
 
205 aa  86.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  32.88 
 
 
219 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.24 
 
 
196 aa  85.5  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  40.46 
 
 
175 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  34.23 
 
 
183 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  35.33 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  26.24 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  35.66 
 
 
197 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  33.56 
 
 
169 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  38.14 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  34.69 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  35.97 
 
 
177 aa  79.3  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  28.77 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.4 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.58 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  33.1 
 
 
183 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  34.68 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.68 
 
 
207 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  22.28 
 
 
585 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  34.72 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  34.68 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  34.03 
 
 
758 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  24.74 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.52 
 
 
590 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  33.87 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  33.87 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.15 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  34.15 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  31.76 
 
 
190 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34 
 
 
252 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  31.76 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.35 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  26.4 
 
 
575 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  23.37 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  34.38 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 
180 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  34.06 
 
 
208 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  29.71 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  28.36 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  29.1 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  27.04 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  29.01 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  22.6 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  22.71 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  25.98 
 
 
558 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  29.71 
 
 
207 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  29.71 
 
 
223 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  27.82 
 
 
597 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  29.71 
 
 
207 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  29.71 
 
 
207 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  29.71 
 
 
207 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  29.71 
 
 
207 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  29.71 
 
 
207 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 
191 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  25.22 
 
 
485 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  26.45 
 
 
593 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  24.24 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.53 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  25.24 
 
 
484 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  26.27 
 
 
575 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  25.55 
 
 
601 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 
598 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  25.74 
 
 
492 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  25.5 
 
 
484 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  25.94 
 
 
585 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.57 
 
 
484 aa  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  28.03 
 
 
191 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  27.48 
 
 
191 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  26.37 
 
 
598 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  26.37 
 
 
598 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  25.41 
 
 
484 aa  63.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  25.55 
 
 
601 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  25.55 
 
 
601 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  24.41 
 
 
548 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>