62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1565 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
191 aa  381  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  98.43 
 
 
191 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  92.67 
 
 
191 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0427  phospholipase D/transphosphatidylase  67.54 
 
 
190 aa  260  8.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31941  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  60.56 
 
 
196 aa  180  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  38.56 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.84 
 
 
484 aa  78.6  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  30.16 
 
 
376 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  31.78 
 
 
359 aa  55.5  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  30.5 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  28.03 
 
 
234 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  31.78 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  31.41 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.37 
 
 
536 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  28.86 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.49 
 
 
366 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  27.01 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  29.92 
 
 
441 aa  48.9  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  26.71 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  29.69 
 
 
230 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  29.92 
 
 
230 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  28.24 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  27.34 
 
 
426 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 
430 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  29.27 
 
 
355 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  28.36 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  25 
 
 
620 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  28.7 
 
 
440 aa  45.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.7 
 
 
586 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.47 
 
 
551 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  33.33 
 
 
545 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  31.19 
 
 
392 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  25.78 
 
 
397 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.56 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5710  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.16 
 
 
391 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.91 
 
 
677 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  29.77 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  33.33 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.22 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  24.28 
 
 
260 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  33.33 
 
 
545 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.46 
 
 
349 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  34.78 
 
 
286 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  28 
 
 
622 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0692  cardiolipin synthase  29.87 
 
 
532 aa  42.7  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.12 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  47.06 
 
 
282 aa  42.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  24.81 
 
 
386 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  25.78 
 
 
397 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  29.46 
 
 
439 aa  42  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
294 aa  41.6  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0101  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.23 
 
 
683 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0642638  normal  0.0241528 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  29.69 
 
 
394 aa  41.6  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  35.71 
 
 
487 aa  41.2  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  36.36 
 
 
528 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 
286 aa  41.2  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  28.57 
 
 
196 aa  41.2  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1603  phospholipase D/transphosphatidylase  25.83 
 
 
396 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420349  normal  0.113302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  24.09 
 
 
422 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>