More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0101 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0434  cardiolipin synthase  66.08 
 
 		 664 aa  887    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0101  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 683 aa  1390    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0642638  normal  0.0241528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03577  cardiolipin synthase  72.59 
 
 		 663 aa  965    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0380  phospholipase D/transphosphatidylase  65.94 
 
 		 652 aa  884    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  36.29 
 
 		 582 aa  229  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  35.77 
 
 		 502 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0603365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1886  cardiolipin synthase  31.45 
 
 		 510 aa  177  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.115754  hitchhiker  0.00782832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3384  cardiolipin synthetase, putative  34.63 
 
 		 525 aa  174  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  31 
 
 		 534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  34.14 
 
 		 517 aa  164  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  32.47 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  34.75 
 
 		 550 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  34.75 
 
 		 550 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  34.75 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  34.75 
 
 		 550 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  34.75 
 
 		 550 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  34.75 
 
 		 550 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  32.28 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  34.75 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.6 
 
 		 517 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.24 
 
 		 557 aa  154  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  33.24 
 
 		 558 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  33.24 
 
 		 553 aa  151  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  33.72 
 
 		 508 aa  151  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  32.57 
 
 		 506 aa  150  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  28.94 
 
 		 510 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.99 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 		 538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.99 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  31.94 
 
 		 514 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  31.93 
 
 		 541 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 517 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  28.9 
 
 		 522 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  31.44 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  34.44 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  31.44 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  31.44 
 
 		 540 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  32.85 
 
 		 544 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.68 
 
 		 524 aa  141  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  28.67 
 
 		 510 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.71 
 
 		 551 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  31.73 
 
 		 549 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6085  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  30.59 
 
 		 562 aa  140  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  30.55 
 
 		 516 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 		 516 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.06 
 
 		 519 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  29.26 
 
 		 507 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.55 
 
 		 534 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  32.56 
 
 		 540 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  31.37 
 
 		 540 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  32.56 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  31.28 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  31.15 
 
 		 516 aa  137  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1121  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.6 
 
 		 535 aa  137  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.95 
 
 		 527 aa  137  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  30.49 
 
 		 517 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  32.02 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  30.64 
 
 		 516 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  30.64 
 
 		 516 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  30.96 
 
 		 514 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  30.64 
 
 		 560 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  29.23 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5200  phospholipase D/transphosphatidylase  35.71 
 
 		 604 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  30.87 
 
 		 516 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  30.4 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  29.11 
 
 		 522 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5202  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 		 602 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.440648  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  28.49 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  28.89 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  30.11 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 		 532 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  31.05 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  27.75 
 
 		 576 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  29.6 
 
 		 548 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  30.49 
 
 		 526 aa  127  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.14 
 
 		 529 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2543  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.67 
 
 		 567 aa  124  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.43955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  25.45 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  29.11 
 
 		 516 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  29.8 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1256  phospholipase D/transphosphatidylase  37.78 
 
 		 625 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20488  normal  0.0365091 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  30.61 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  30.61 
 
 		 473 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  30.61 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  30.61 
 
 		 473 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.61 
 
 		 493 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  30.61 
 
 		 473 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  28.87 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  30.61 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  30.32 
 
 		 473 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  30.27 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.4 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0412  phospholipase D/transphosphatidylase  27.04 
 
 		 560 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127464  hitchhiker  0.00000145574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  29.75 
 
 		 434 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  29.75 
 
 		 434 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  29.75 
 
 		 434 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>