More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1886 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1886  cardiolipin synthase  100 
 
 		 510 aa  1060    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.115754  hitchhiker  0.00782832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  45.81 
 
 		 502 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0603365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3384  cardiolipin synthetase, putative  46.85 
 
 		 525 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  32.18 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  32.02 
 
 		 522 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  32.85 
 
 		 558 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  33.69 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  31.91 
 
 		 549 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.29 
 
 		 557 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  32.53 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  32.53 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  32.01 
 
 		 516 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  33.68 
 
 		 553 aa  230  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.72 
 
 		 517 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 		 562 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  32.32 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  33.33 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  34.78 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  33.75 
 
 		 595 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  33.75 
 
 		 550 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  33.75 
 
 		 550 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  33.75 
 
 		 550 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  33.75 
 
 		 550 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  33.75 
 
 		 550 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  31.72 
 
 		 540 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  32.35 
 
 		 535 aa  226  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  31.46 
 
 		 516 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  33.54 
 
 		 550 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  33.64 
 
 		 541 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  32.44 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  31.57 
 
 		 516 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  31.57 
 
 		 516 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  31.57 
 
 		 560 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  31.11 
 
 		 540 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  31.12 
 
 		 514 aa  223  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  31.97 
 
 		 517 aa  223  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  32.06 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.61 
 
 		 519 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  34.43 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 		 538 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  30.75 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  30.65 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  35.76 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  31.63 
 
 		 507 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.34 
 
 		 564 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.34 
 
 		 564 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  31.81 
 
 		 543 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  31.29 
 
 		 544 aa  213  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  30.63 
 
 		 576 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  31.07 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  31.01 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  30.95 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  31.07 
 
 		 540 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  30.93 
 
 		 522 aa  209  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  29.28 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.86 
 
 		 493 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  32.33 
 
 		 495 aa  206  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  29.72 
 
 		 516 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  29.72 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.84 
 
 		 529 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.18 
 
 		 520 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2543  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.04 
 
 		 567 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.43955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  28.88 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  31.24 
 
 		 508 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  34.19 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  34.19 
 
 		 476 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  34.63 
 
 		 434 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  34.63 
 
 		 434 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  34.63 
 
 		 434 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  34.63 
 
 		 434 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  34.19 
 
 		 476 aa  200  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  34.63 
 
 		 434 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 520 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  34.19 
 
 		 476 aa  200  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  34.52 
 
 		 473 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  34.12 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  31.3 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  34.12 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  30.26 
 
 		 516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  32.64 
 
 		 529 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0434  cardiolipin synthase  29.4 
 
 		 664 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.74 
 
 		 517 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  33.89 
 
 		 473 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  31.09 
 
 		 517 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0380  phospholipase D/transphosphatidylase  29.2 
 
 		 652 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.68 
 
 		 551 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.7 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.44 
 
 		 514 aa  193  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  27.97 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  29.84 
 
 		 522 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.58 
 
 		 527 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  30.71 
 
 		 515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  29 
 
 		 518 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4772  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.49 
 
 		 583 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0797  phospholipase D/transphosphatidylase  31.28 
 
 		 566 aa  189  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  30.35 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  31.74 
 
 		 570 aa  188  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  27.59 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>