238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3503 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 180 aa  353  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  95 
 
 		 180 aa  299  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  52.35 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  36.42 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.89 
 
 		 484 aa  74.7  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  27.78 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  28.74 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  34.81 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  26.39 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  35.76 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0427  phospholipase D/transphosphatidylase  32.12 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  32.52 
 
 		 401 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  31.01 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.87 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  30.86 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  32.74 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  29.93 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  29.93 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  32.72 
 
 		 400 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  28.39 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  33.08 
 
 		 400 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  29.93 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  31.06 
 
 		 355 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  33.08 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  30.67 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  34.23 
 
 		 555 aa  54.7  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  36 
 
 		 547 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  33.67 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  27.17 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  29.65 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  33.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  33.67 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  31.9 
 
 		 401 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  33.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  33.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  33.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  33.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  33.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.34 
 
 		 395 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  28.49 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  36.79 
 
 		 477 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.17 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  34.11 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  28.87 
 
 		 446 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  33 
 
 		 395 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.77 
 
 		 349 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  27.16 
 
 		 245 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  35.83 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  30.18 
 
 		 426 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  30.48 
 
 		 492 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  30.19 
 
 		 484 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  27.81 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.22 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.03 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  31.65 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.43 
 
 		 622 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  31.65 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.41 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  34.58 
 
 		 556 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  32.29 
 
 		 412 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  27.5 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.58 
 
 		 464 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  30.37 
 
 		 413 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  30.37 
 
 		 413 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  30.37 
 
 		 413 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  30.71 
 
 		 500 aa  48.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  27.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4882  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  30.37 
 
 		 413 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  27.5 
 
 		 207 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.99 
 
 		 453 aa  48.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  30.37 
 
 		 413 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  34.95 
 
 		 480 aa  48.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.58 
 
 		 464 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  27.4 
 
 		 392 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  32.33 
 
 		 363 aa  47.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  31.2 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1045  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.62 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  31.2 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  33.06 
 
 		 460 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.5 
 
 		 207 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  38.46 
 
 		 518 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  30.39 
 
 		 484 aa  47.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0865  cardiolipin synthetase  34.07 
 
 		 589 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000163382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  35.11 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.65 
 
 		 396 aa  47.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  35.04 
 
 		 439 aa  47.4  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  30.7 
 
 		 413 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  33.01 
 
 		 486 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.1 
 
 		 392 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.25 
 
 		 483 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  33.01 
 
 		 486 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  34.62 
 
 		 502 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  33.01 
 
 		 486 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.17 
 
 		 498 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.56 
 
 		 476 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 		 485 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  30.6 
 
 		 386 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  29.63 
 
 		 413 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  30.48 
 
 		 458 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>