144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2720 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  54.42 
 
 
213 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  54.42 
 
 
213 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  39.73 
 
 
176 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  39.58 
 
 
404 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  42.86 
 
 
176 aa  117  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  42.86 
 
 
176 aa  117  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  43.7 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  37.72 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  39.6 
 
 
234 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  42.86 
 
 
393 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  35.36 
 
 
176 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.57 
 
 
198 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.02 
 
 
196 aa  106  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  34.23 
 
 
183 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  40.34 
 
 
197 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.71 
 
 
219 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  40.56 
 
 
193 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  33.55 
 
 
169 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  37.77 
 
 
190 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  38.95 
 
 
175 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  39.26 
 
 
188 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.69 
 
 
245 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  33.52 
 
 
180 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  37.96 
 
 
242 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  37.14 
 
 
207 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.67 
 
 
207 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.14 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  37.14 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  36.67 
 
 
242 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  37.87 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  40.44 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.03 
 
 
229 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  31.55 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  34.36 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  34.01 
 
 
376 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  34.39 
 
 
223 aa  91.3  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  33.73 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  33.73 
 
 
223 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  33.73 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  33.73 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  33.73 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  33.73 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  33.73 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  37.5 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  34.56 
 
 
230 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.33 
 
 
386 aa  87.8  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  33.82 
 
 
230 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  38.4 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  38.19 
 
 
758 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  33.33 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  37.41 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  33.33 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  36.64 
 
 
392 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  35.97 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.71 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  36.99 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  27.48 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  34.81 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  25.63 
 
 
487 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.2 
 
 
252 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  24.56 
 
 
481 aa  62  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  32.28 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.85 
 
 
203 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  29.27 
 
 
359 aa  58.2  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.48 
 
 
349 aa  58.2  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  27.92 
 
 
206 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  34.81 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  34.17 
 
 
439 aa  56.6  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  32.76 
 
 
355 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  28.78 
 
 
286 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  28.06 
 
 
286 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  29.05 
 
 
210 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  26.52 
 
 
505 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  31.82 
 
 
394 aa  52.4  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0795  hypothetical protein  30.28 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1276  hypothetical protein  30.28 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.96 
 
 
366 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1166  hypothetical protein  30.36 
 
 
173 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.112926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  25.41 
 
 
260 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  27.94 
 
 
151 aa  51.6  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  28.36 
 
 
294 aa  50.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4419  hypothetical protein  31.34 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.429401  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  26.09 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  23.48 
 
 
300 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1248  hypothetical protein  30.5 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.11619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1154  hypothetical protein  29.76 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.86 
 
 
484 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.45 
 
 
263 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  24.31 
 
 
467 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  24.73 
 
 
545 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_002620  TC0557  phospholipase D family protein  28.49 
 
 
474 aa  47.8  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  28.93 
 
 
467 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.4 
 
 
622 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  24.73 
 
 
545 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5710  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.97 
 
 
391 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2043  hypothetical protein  30.46 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  32.76 
 
 
356 aa  47.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  26.72 
 
 
448 aa  46.6  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 
463 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>